Сeквенирование нуклеиновых кислот презентация

Метод блуждающего пятна или «Сенгерпринт» Пометить олигонуклеотид по 5’- или 3’- концу. Частичный гидролиз олигонуклеотида соответствующими экзонуклеазами. Электрофорез на ацетате целлюлозы при рН 3,5 Гомохроматографию на DEAE-целлюлозе. Радиоавтография полученной хроматограммы Расшифровка

Слайд 1Сeквенирование нуклеиновых кислот


Слайд 2Метод блуждающего пятна или «Сенгерпринт»
Пометить олигонуклеотид по 5’- или 3’- концу.
Частичный

гидролиз олигонуклеотида соответствующими экзонуклеазами.
Электрофорез на ацетате целлюлозы при рН 3,5
Гомохроматографию на DEAE-целлюлозе.
Радиоавтография полученной хроматограммы
Расшифровка результатов

Слайд 3

Электрофорез на ацетате целлюлозы
в аммоний ацетатном буфере при рН 3,5
-
+

DEAE-целлюлоза












Слайд 4
Гомохроматография на DEAE-целлюлозе











-A
-T
-G
-A
-C
-T
-T
-C
-T
-A
p*NATCTTCAGTA
-C
-A
-G
-T

Частичный гидролизат tРНК


Слайд 5рК оснований
6.4
1.0
9.5 (N-3)
5’-UMP
6.3
0.8
4.5 (N-3)
5’-CMP
6.1
0.7
9.4 (N-1)
2.4 (N-7)
5’-GMP
6.1
0.9
3.8 (N-1)
5’-AMP
рК2 фосфата
pK1 фосфата
рКа оснований-N
Нуклеотиды


Слайд 6Протонирование оснований при рН 3,5


Слайд 7Общий заряд олигонуклеотида рGATCTTCAGTA и его фрагментов


Слайд 8Определение последовательности нуклеиновых кислот методом Максама - Гилберта
Пометить фрагмент ДНК (РНК)

с 5’- или 3’- конца
Провести 4 химические реакции для отщепления оснований от цепи НК
Расщепить сахарофосфатный остов в местах где отсутствуют основания
Гель-электрофорез в ПААГ
Радиоавтография
Расшифровка результатов

Слайд 9Отщепление пуриновых оснований под действием 60% HCOOH


Слайд 10Отщепление гуанина под действием Me2SO4


Слайд 11Отщепление тимина под действием гидразина


Слайд 12Отщепление цитозина под действием гидразина в присутствии 2М NaCl


Слайд 13Общая схема проведения секвенирования по Максаму - Гилберту
Т4-полинуклеотидкиназа, γ-АТФ
Рестриктаза EcoR I
Разделение

фрагментов

5’ – GATCGCTATACGAGAATTCAGCTCGA - 3’
3’ – CTAGCGATATGCTCTTAAGTCGAGCT - 5’


5’-*pGATCGCTATACGAGAATTCAGCTCGA - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAAGTCGAGCTp*-5’


5’-*pGATCGCTATACGAG AATTCAGCTCGA - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA GTCGAGCTp*-5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’- AATTCAGCTCGA - 3’
3’ - GTCGAGCTp*-5’

5’-*pGATCGCTATACGAGAATTCAGCTCGA - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAAGTCGAGCTp*-5’


Слайд 145’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’
Me2SO4
H+
NH2-NH2
NH2-NH2 +NaCl
Химическая модификация
по Максаму-Гилберту
5’-*pGATCGCTATACGAG

- 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTA A -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’

5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’
3’ - CTAGCGATATGCTCTTAA -5’


Слайд 15G
A+G
T+C
C
*pGATCGCTATACGA
*pGATCGCTATAC
*pGATC
*p
*pGATCGCTATACGA
*pGATCGCTATACG
*pGATCGCTATAC
*pGATCGCTAT
*pGATCGCT
*pGATC
*pG
*p
*pGATCGCTATA
*pGATCGCTA
*pGATCGC
*pGATCG
*pGAT
*pGA
*pGATCGCTATA
*pGATCG
*pGAT
5’-*pGATCGCTATACGAG - 3’


Слайд 16




G
G+A
T+C
C
GAGCATATCGCTAG
3’-
5’-


Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика