- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Сравнительный анализ пространственных структур белков презентация
Содержание
- 1. Сравнительный анализ пространственных структур белков
- 2. Пример 1: Белки, не имеющие постоянной формы Протимозин альфа
- 3. Фибриллярные белки Coiled coil (миозин, альфа-кератин) Тройная спираль (коллаген) Бета-спираль (паутина)
- 4. Пример 2a: Миозин – фибриллярный белок
- 5. Пример 2b: Тропомиозин из сердечной мышцы кролика
- 6. Упражнение: примерно какой длины последовательность спирализованного хвоста миозина?
- 7. 2c: Как coiled coil проявляется в последовательности?
- 8. 2d: Как лейциновая молния (Leucine zipper) проявляется
- 9. Пример 2e: использование лейциновых молнии в транскрипционных
- 10. Большая бороздка Малая бороздка Большая бороздка
- 11. Вот как расположены домены ‘лейциновая молния’ при
- 12. Белки colied coil 1M1J: native chicken
- 13. Пример 3: тропоколлаген – тройная спираль 1BKV:
- 14. Три цепи тройной спирали одинаковы, регулярны, параллельны и “близки” к бета-тяжам
- 15. Тройная спираль удерживается водородными связями остовных атомов
- 16. Схема водородных связей в тройной спирали. Полярные
- 17. ПРАВИЛО: Цепь A Цепь C
- 18. Еще одна схема тех же связей
- 19. Модель коллагена (5 цепей тропоколлагена) Соседние
- 20. Пример 4. Фиброин паутины -бета-спираль
- 21. Миоглобин свиньи в комплексе с гемом, O2
- 22. Токарный станок – это фермент, катализирующий реакцию
Пример 1: Белки, не имеющие постоянной формы Протимозин альфа
Слайд 3Фибриллярные белки
Coiled coil (миозин, альфа-кератин)
Тройная спираль (коллаген)
Бета-спираль (паутина)
Слайд 4Пример 2a: Миозин – фибриллярный белок
Схема из книги C.Branden, J.Tooze
“Introduction to protein structure”
Слайд 5Пример 2b: Тропомиозин из сердечной мышцы кролика (это не миозин, но
тоже двойная спирализованная спираль - coiled coil)
PDB 2TMA. РСА, разрешение 15 ангстрем
Две параллельные альфа-спирали
Слайд 72c: Как coiled coil проявляется в последовательности? Например, лейциновой молнией
Белок SCP1
из синаптонемного комплекса – тоже coiled coil
Слайд 82d: Как лейциновая молния (Leucine zipper) проявляется в структуре?
Показаны каждый 7й
остаток
цепей A и B;
Leu - зеленые (A) и
темнозеленые (B)
Leu - зеленые (A) и
темнозеленые (B)
Лейциновая молния
PDB код 1ci6
Слайд 9Пример 2e: использование лейциновых молнии в транскрипционных факторах для узнавания участков
ДНК с определенной последовательностью (“специфическое узнавание ДНК”)
Слайд 10Большая бороздка
Малая бороздка
Большая бороздка
Сахарофосфатный остов ‘прямой’ цепи
Сахарофосфатный остов ‘обратной’
цепи
5’
5’
3’
3’
Вот что нужно узнавать!
Слайд 11Вот как расположены домены ‘лейциновая молния’ при связывании ДНК
1NWQ: транскрипционный фактор
CCAAT/enhancer-binding
protein (C/EBPs) крысы
Слайд 12 Белки colied coil
1M1J: native chicken fibrinogen
три параллельных спирали. 2.7Å
1QU7: E.coli
cytoplasmic domain
of a serine chemotaxis receptor.2.6Å
Четыре антипараллельных спирали
of a serine chemotaxis receptor.2.6Å
Четыре антипараллельных спирали
Слайд 13Пример 3: тропоколлаген – тройная спираль
1BKV: синтетический
коллагеноподобный
белок с природной
последовательностью
PRO-HYP-
GLY-PRO-HYP-GLY-PRO-HYP-GLY-ILE-THR-GLY-ALA-ARG-GLY-LEU-ALA-GLY-PRO-HYP-GLY-PRO-HYP-GLY-PRO-HYP-GLY-PRO-HYP-
=========
G-X-X
Слайд 15Тройная спираль удерживается водородными связями остовных атомов
Цепь A
Цепь C
Цепь B
i-я тройка
(i+1)-я
i-я
тройка:
Gly-Pro-Hyp
(i+1)-я:
Gly-Pro-Hyp
Gly-Pro-Hyp
(i+1)-я:
Gly-Pro-Hyp
Слайд 16Схема водородных
связей в тройной спирали.
Полярные атомы Gly.O и
Hyp.O не образуют
водо-
родных связей
родных связей
Слайд 17ПРАВИЛО:
Цепь A
Цепь C
Цепь B
Gly.N из (i+1)-й тройки цепи образует водородную связь
с Pro.O из i-й тройки следующей по стрелке цепи
Слайд 19Модель коллагена (5 цепей тропоколлагена)
Соседние
тропоколлагены
связаны водородными
связями
гидроксильных групп
гидроксипролина
с остовными
кислородами
Слайд 22Токарный станок – это фермент, катализирующий реакцию превращения заготовки в деталь,
имеющую цилиндрическую, коническую или любую форму тела вращения
3 м
3 см
