ДНК диагностика фитопатогенов презентация

Содержание

Слайд 1ДНК диагностика фитопатогенов


Слайд 2Методы диагностики
Визуальный
Индикаторные растения
Электронная микроскопия
Серологическая диагностика
ДНК диагностика


Слайд 3ДНК диагностика
Полимеразная цепная реакция – ПЦР
Традиционная ПЦР
ПЦР в реальном времени
Детекция после

ПЦР (end-point detection)
Биочипы


Слайд 4ДНК диагностика
Сбор материала
Экстракция нуклеиновых кислот (ДНК, РНК)
Постановка полимеразной цепной реакции (ПЦР)
Регистрация

сигнала
Обработка результатов

Слайд 5Полимеразная цепная реакция – ПЦР
После проведения реакции из одной молекулы ДНК

образуется миллионы идентичных копий

Слайд 6ДНК диагностика
Диагностика урогенитальных инфекций (хламидиоз, микоплазмоз, уреаплазмоз, кандидоз и др.).

Вирусные заболевания

(гепатиты В и С, вирус папилломы человека, ВИЧ).

Детекция микобактерий туберкулеза.

Изучение экспрессии генов в различных тканях

Анализ SNPs.

Детекция трансгенов.

Применение в селекции растений.

Детекция фитопатогенов.

Слайд 7Детекция фитопатогенов
Контроль безвирусного посадочного материала
Детекция вироидов
Детекция фитоплазм
Детекция вирусов в насекомых-переносчиках


Слайд 8Используется с 1995 г.


Слайд 9Диагностика должна быть:
Быстрой
Дешевой
Точной
Чувствительной
Широко применимой
Воспроизводимой



Слайд 10Подходы к диагностике
Одновременный анализ большого количества образцов на один фитопатоген
Анализ в

одном образце большого числа фитопатогенов


Слайд 11Традиционная ПЦР
Быстрота анализа.
Высокая точность.
Воспроизводимость.
Простота, легкость в применении.


Слайд 12Недостатки традиционной ПЦР
Длительность.

Высокий риск контаминации.

Высокие затраты при массовых анализах.

Ядовитые реагенты (EtBr).

ТРУДОЕМКОСТЬ


Слайд 13Молекулярные беконы – структура шпильки.

TaqMan-зонды – линейные зонды (Roche Diagnostics).

«Скорпион»-зонды –

структура шпильки и билинейная (Invitrogen).

ПЦР в реальном времени



Слайд 14Молекулярный бекон (Molecular Beacon).


Слайд 15МОЛЕКУЛЯРНЫЕ БЕКОНЫ


Слайд 16МОЛЕКУЛЯРНЫЕ БЕКОНЫ


Слайд 17TaqMan-зонд - в процессе проведения ПЦР происходит освобождение флуоресцентной метки
ДНК-зонд гибридизуется

с амплифицируемой последовательностью

ДНК-зонд в процессе амплификации разрушается ДНК-полимеразой и метка начинает флуоресцировать


Слайд 18«СКОРПИОН»-ЗОНДЫ


Слайд 19Сравнение технологий


Слайд 20Используя разные флуоресцентные метки можно детектировать в пробирке разные ПЦР продукты


Слайд 21Детекция флюоресценции
Детекция в режиме
реального времени
(Real-time PCR)
Детекция после ПЦР
(end-point detection)


Слайд 22Детекция флюоресценции
Real-time PCR
End-point detection


Слайд 23Преимущества ПЦР в реальном времени:

- все операции проводятся в одной пробирке;
-

исключается риск контаминации ПЦР-смеси и продуктов;


- быстрота анализа;
- возможность автоматизации;



- экономия затрат времени и труда.

Слайд 24Преимущества ПЦР в реальном времени:
Чувствительность
В 10000 раз более чувствительнее чем ELISA
В

100 раз более чувствительнее чем обычный ПЦР


Слайд 25Детекция вироида веретеновидности клубней картофеля PSTVd


Слайд 26Детекция вироида веретеновидности
клубней картофеля PSTVd
кДНК
РНК
ОТ-ПЦР
Real-time PCR
или
End-point detection


Слайд 27Детекция картофельного вироида PSTVd


Слайд 28Детекция картофельного вироида PSTVd


Слайд 29Детекция картофельного вироида PSTVd


Слайд 30Детекция вирусов X и Y картофеля
Детекция вируса Y
Детекция вируса Х


Слайд 31Детекция вирусов картофеля
Сокращение времени детекции
в 2 раза
Детекция вируса Х картофеля с

помощью Real-time ПЦР

Слайд 32Диагностикумы
Картофель: Вирусы Х и Y, вирус скручивания листьев картофеля, вироид веретеновидности

клубней картофеля
Земляника: вирус кольцевого пожелтения жилок листа, вирус крапчатости листьев, вирус слабого краевого пожелтения листа, вирус морщинистости листьев земляники, микоплазмы;
Огурец: Вирус огуречной мозаики, вирус зеленой крапчатой мозаики.

Слайд 33Возможность использования в полевых условиях


Слайд 34Возможность использования в полевых условиях
Экстракция ДНК




ПЦР


Слайд 35Биочипы
Возможность одновременно детекции более 30000 мишеней


Слайд 37Центр молекулярной биотехнологии


Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика