и
Ю.А. Овчинникова РАН
Лаборатория структуры и функции генов человека.
Руководитель: к.б.н., с.н.с. Акопов С.Б.
- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Исследование тканеспецифичности энхансерной активности LTR HERV-K Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН Лаборатория структуры и функции генов человека. Руководитель: к.б.н., с.н.с. Акопов С.Б. презентация
Содержание
- 1. Исследование тканеспецифичности энхансерной активности LTR HERV-K Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН Лаборатория структуры и функции генов человека. Руководитель: к.б.н., с.н.с. Акопов С.Б.
- 2. Свойства ретровирусов Вирионы ретровирусов окружены липопротеидной
- 4. Структура LTR
- 5. Образование одиночных LTR в геноме
- 6. Потенциальная роль HERV в патогенезе Индукция геномной
- 7. Задачи Наработать и проверить векторные конструкции. Методом
- 8. Расположение LTR L47334 на хромосоме 19 человека
- 9. R Транскрипция TATAA AATAGGAGACTCCATTTTG
- 10. Схема исследования энхансерной активности LTR HERV-K
- 11. Использованные плазмиды
- 12. Использованные плазмиды
- 13. Контрольная плазмида
- 16. Результаты LTR LTR Luc Pr SV 40
- 17. Результаты
- 18. Результаты Энхансер SV-40 Энхансер
- 19. Выводы Показано наличие энхансерной активности LTR, принадлежащего
Свойства ретровирусов Вирионы ретровирусов окружены липопротеидной оболочкой. Геном представлен двумя однонитевыми нефрагментированными молекулами РНК. Репликация имеет две уникальные черты: а) с помощью вирус-специфичного фермента обратной транскиптазы осуществляется перевод РНК в
Слайд 1Исследование тканеспецифичности энхансерной
активности LTR HERV-K
Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина
Слайд 2Свойства ретровирусов
Вирионы ретровирусов окружены липопротеидной оболочкой.
Геном представлен двумя однонитевыми нефрагментированными
молекулами РНК.
Репликация имеет две уникальные черты: а) с помощью вирус-специфичного фермента обратной транскиптазы осуществляется перевод РНК в ДНК форму, б) новосинтезированная ДНК интегрирует в геном инфицированной клетки.
Репликация имеет две уникальные черты: а) с помощью вирус-специфичного фермента обратной транскиптазы осуществляется перевод РНК в ДНК форму, б) новосинтезированная ДНК интегрирует в геном инфицированной клетки.
Слайд 3
U3
R
U5
U3
R
U5
gag pol env
8. Транспорт РНК
7. Процессинг РНК
6. Транскрипция
LTR
LTR
Cap
(A)n
Геномная
РНК вируса
Cap
(A)n
Сплайсированная РНК
Белки
9. Трансляция
10.Сборка вируса
3. Освобождение
РНК
4. Обратная
транскрипция
5. Интеграция
Вирус
11. Выход из клетки
Вирус (вирусоподобная частица)
2. Проникновение
в клетку
1. Взаимодействие
с рецептором
Схема жизненного цикла ретровирусов
Слайд 5Образование одиночных LTR в геноме
U3
R
U5
U3
R
U5
gag
pol env
LTR
LTR
Рекомбинация
Транскрипция
Одиночный LTR
Слайд 6Потенциальная роль HERV в патогенезе
Индукция геномной нестабильности
Активация или инактивация генов, вовлечённых
в регуляцию клеточного цикла
Продуцирование иммуносупреcсивных факторов
Изменение нормальной регуляторной функции HERV
Продуцирование иммуносупреcсивных факторов
Изменение нормальной регуляторной функции HERV
Scand. J. Immunol. 48, 329-338,1998
Слайд 7Задачи
Наработать и проверить векторные конструкции.
Методом транзиентной экспрессии репортерного гена люциферазы измерить
энхансерную активность полноразмерного и частично делетированного LTR в различных линиях клеток.
Статистически обработать полученные результаты.
Оценить тканеспецифичность экспрессии полноразмерного и частично делетированного LTR.
Сравнить активность полноразмерного и частично делетированного LTR в исследованных линиях клеток.
Статистически обработать полученные результаты.
Оценить тканеспецифичность экспрессии полноразмерного и частично делетированного LTR.
Сравнить активность полноразмерного и частично делетированного LTR в исследованных линиях клеток.
Исследование тканеспецифичности энхансерной активности LTR HERV-K
Слайд 8Расположение LTR L47334 на хромосоме 19 человека
Z
N
F
1
3
4
Z
N
F
Z
N
F
ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
LYMPHOID LEUKEMIA
LEUKEMIA
HEMOLYTIC ANEMIA
MALIGNANT
HYPERTHERMIA
MYOTONIC DYSTROPHY
Pr1
Pr2
33bp
23bp
923bp
Слайд 9
R
Транскрипция
TATAA
AATAGGAGACTCCATTTTG
AATAAA
Участок связывания белков ERF и YY1
Промотор
Сигнал
полиаденилирования
Структура LTR HERV-K
U3
U5
Негативный
регулятор
R
TATAA
AATAGGAGACTCCATTTTG
AATAAA
U3
Полноразмерный LTR
LTR с делецией негативного регулятора
Слайд 10
Схема исследования энхансерной активности LTR HERV-K с использованием системы экспрессии репортерного
гена
или
Клонирование в репортерный вектор,
лишенный энхансера.
Трансфекция ДНК в
клетки млекопитающих
Измерение активности
люциферазы
ПЦР-амплификация LTR
Слайд 19Выводы
Показано наличие энхансерной активности LTR, принадлежащего семейству HERV-K (HML-2), в клеточной
линии тератокарциномы Tera-1.
Обнаружена зависимость эффективности энхансера от клеточной линии, то есть его тканеспецифичность.
Показано, что активность энхансера SV40 для линий NT2/D1, Tera-1, HeLa, NGP-127, CHO-K1 значительно превышает активность в линиях Jurkat, HL-60, 293.
Показано, что делеция сайленсер-подобного элемента в U5 области LTR HERV-K не влияет на энхансерную активность этого LTR.
Обнаружена зависимость эффективности энхансера от клеточной линии, то есть его тканеспецифичность.
Показано, что активность энхансера SV40 для линий NT2/D1, Tera-1, HeLa, NGP-127, CHO-K1 значительно превышает активность в линиях Jurkat, HL-60, 293.
Показано, что делеция сайленсер-подобного элемента в U5 области LTR HERV-K не влияет на энхансерную активность этого LTR.
