Хромосомный микроматричный анализ презентация

Содержание

СИНДРОМ - ? ВПС Особенности фенотипа Аномалии соединительной ткани Задержка развития Особенности характера и поведения Задержка роста Эндокринные нарушения

Слайд 1И.В. Канивец
ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ

Слайд 2СИНДРОМ - ?
ВПС
Особенности фенотипа
Аномалии соединительной ткани
Задержка развития

Особенности характера и поведения
Задержка роста
Эндокринные

нарушения

Слайд 3СИНДРОМ - ?
Неонатальная гипотония
Нормальный или ускоренный рост
Тяжелая задержка развития

Нормальная окружность головы
Множественные

МАР

Слайд 41 970,0 млн USD
469,2 млн USD

Слайд 51 970,0 млн USD
469,2 млн USD
dup 17p11.2
del 1p36
del 9q34.3
del 3q29
del 22q13.3
dup7q11.23
del

15q24

dup 22q11.2

Слайд 6ХРОМОСОМНАЯ ПАТОЛОГИЯ ОПРЕДЕЛЕНИЕ
Хромосомная патология – любое нарушение числа и/или структуры хромосом

Слайд 7ХРОМОСОМНАЯ ПАТОЛОГИЯ КЛИНИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ
числовые и структурные аномалии хромосом (за исключением сбалансированных) патогенны
характеризуются

мультисистемным поражением
являются причиной задержки развития/умственной отсталости
часто является причиной потери беременности

многие микроделеционные синдромы не имеют четкого фенотипа и часто остаются недиагностированными
не могут быть вылечены
могут возникать повторно при следующих беременностях
являются показанием для консультации врача-генетика

Слайд 8ЭВОЛЮЦИЯ ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ

Термин «кариотип» впервые появился в Pubmed
Был предложен
термин «хромосома»
48 хромосом
у

человека

Разработаны методы окраски хромосом

Установлено количество хромосом у человека

FISH

BAC array CGH

Oligo array CGH и SNP хромосомный микроматричный анализ

1947

1888

1923

1970s

1956

1986

2002

2004

ACMG & ISCA рекомендуют заменить кариотипирование хромосомным микроматричным анализом

2010

2012

Хромосомный микроматричный анализ зарегистрирован в России как медицинский тест

Слайд 9НА ПУТИ К МОЛЕКУЛЯРНОМУ КАРИОТИПИРОВАНИЮ

Слайд 10НА ПУТИ К МОЛЕКУЛЯРНОМУ КАРИОТИПИРОВАНИЮ

Слайд 11КАК ВЫЯВИТЬ ВСЕ КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ CNV?


Слайд 12Хромосомный микроматричный анализ – молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК

по сравнению с набором проб или маркеров, покрывающих определенный набор генов или весь геном, без необходимости культивирования клеток
Синонимы: молекулярное кариотипирование, сравнительная геномная гибридизация на чипах, молекулярно-цитогенетическое исследование

ОПРЕДЕЛЕНИЕ

Слайд 13ИСТОРИЯ
Первый прототип микроматицы на микроскопном стекле
1993

Создание микроматрицы с общей последовательностью проб >1 млн. нуклеотидов
1995 Первая опубликованная научная работа с использованием микроматриц (Shena et al.)
1996 Промышленный выпуск микроматриц (Affymetrix)
1997 Полногеномный экспрессионный анализ S. cerevisiae (De Risi et al.)
1999 Молекулярная классификация опухоли и использованием микроматриц (Goluet al.)
2000 Молекулярный фенотип опухли (Pat Brown et Al.)
2003 Производители микроматриц Affymrtrix, Illumina, Agilent, Nimblegen (Roche) и мн. др.
2004 Полногеномный анализ на одной микроматрице (Affymetrix)
2005 Первая микроматрица одобренная FDA (Amplichip, Roche)
2008 Широкое использование разных типов микроматриц – SNP, CNV, Expression, ChIP, Tilling и пр.
2011 >100,000 исследований с использованием микроматриц в молекулярной цитогенетике.
Выявление причин ВПР и ЗПМР в 20-25% случаев.

Слайд 14СРАВНИТЕЛЬНАЯ ГЕНОМНАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ

Слайд 15ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ

Слайд 16Normal 2N
AA:(0.5+0.5)=+1
AB: 0.5-0.5 = 0
BB: 0-(0.5+0.5)=-1
Loss 1N
A:0.5-0 =+0.5
B:0-0.5=-0.5
Mosaic loss
Mosaic gain
Loss of

heterozigosity

AA

AB

BB

A

B

Gain 3N
AAA:(0.5+0.5+0.5)=+1.5
AAB: (0.5-0.5 )-0.5 = +0,5
ABB: 0.5-(0.5+0.5)=-0.5
BBB: 0-(0.5+0.5+0,5)=-1.5

AAA

AAB

ABB

BBB

Each point represent a single SNP interrogated by A or B alleles probes and assigned an arbitrary fluorescence uni of haploid locus (single allele) =0,5
A-B=?

АНАЛИЗ СИГНАЛА ОТ SNP

Слайд 17CGH или ХМА?

Слайд 18Распределение проб на микроматрицах разной плотности
Микроматрица 400К – 90%

Микроматрица 2,67М – 99,6%

Клиническая достоверность

Слайд 19МИКРОМАТРИЦЫ ВЫСОКОЙ, СРЕДНЕЙ И НИЗКОЙ ПЛОТНОСТИ



2,7 млн
750 тыс
180 тыс

Слайд 20ТЕОРЕТИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ РАЗРЕШАЮЩЕЙ СПОСОБНОСТИ МИКРОМАТРИЦ
Размер определяемых микроделеций и микродупликаций зависит от

параметров маркерных сигналов на микроматрице
1. Волнистость (Waviness SD)
глобальная мера распределения зондов, которая нечувствительна
к вариациям распределения на коротких расстояниях и сфокусирована
на больших расстояниях
2. Различие в интенсивности сигнала между двумя соседними маркерами (MAPD - Median of the Absolute values of all Pairwise Differences)

При Волнистости <=0,12 и MAPD <=0,25 точность определения CNVs 99,5% достигается при включении в анализ 20 маркеров для делеций и 50 маркеров для дупликаций.

Для генов, рекомендованных ISCA плотность маркеров составляет 1 маркер на 384 нуклеотида

Таким образом, теоретически возможная минимальная разрешающая способность ХМА составляет 7680 для делеций и 19200 для дупликаций


Слайд 21ОПРЕДЕЛЕНИЕ РАЗРЕШАЮЩЕЙ СПОСОБНОСТИ МИКРОМАТРИЦЫ В ХОДЕ ИССЛЕДОВАНИЙ
Отсутствие маркеров в области интрона



Область

отсутствия гетерозиготности

Гетерозиготная делеция 31 экзона гена EP300, размер 1297 п.н.


Слайд 22Пациент Л.
Клиническая картина: Задержка развития, фенотип синдрома Рубинштейна-Тейби
Молекулярный кариотип: arr[hg19] 16p13.3(3828749_3833104)x1

Размер 4355 пн.
Обнаружена делеция двух экзонов гена CREBBP, ассоциированного с синдромом Рубинштейна-Тейби

Слайд 23КАКОЕ РАЗРЕШЕНИЕ ВЫБРАТЬ?

Слайд 24DNA extraction
Digestion
Ligation
PCR amplification
QC control 1

Purification

Fragmentation
Quantitation
QC control 2
Labelling
Hybridization
Washing and staining
Scanning
Data processing
Data analysis
Report
1
2
3
4
ЭТАПЫ

ХРОМОСОМНОГО МИКРОМАТРИЧНОГО АНАЛИЗА

46 пипетирований, 10 стадий и 2,5 дня от образца до результата

Слайд 25ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ХМА

Слайд 26Вариация числа копий (CNV) – это изменение числа копий определенного сегмента

ДНК размером, по крайней мере, 1000 п.н., по сравнению с репрезентативным референсным геномом.
Термин «CNV» не подразумевает исходно обязательной клинической значимости, поэтому CNVs классифицируются на патогенные, непатогенные и CNVs с неизвестной значимостью.

ВАРИАЦИИ ЧИСЛА КОПИЙ ДНК (CNV)

Слайд 27СРЕДНЕЕ КОЛИЧЕСТВО CNV У ЧЕЛОВЕКА
Частота (%)

Слайд 28ОПРЕДЕЛЕНИЕ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТИ (КАУЗАТИВНОСТИ) CNVs

Базы данных OMIM, ISCA, DECIPHER, GeneReviews, литературные

данные -PubMed

Слайд 29Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?



ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 30Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?



ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 31ПОПУЛЯЦИОННЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ CNVs
http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home

Слайд 32Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?

ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 33Обнаружены микроделеции участков длинного плеча 17 хромосомы в регионе 17q21.31, размер

564 kb и 537 kb соответственно. Подобные микроделеции являются причиной Koolen-De Vries syndrome (OMIM 610443)

Koolen-De Vries syndrome (OMIM 610443) Chromosome 17q21.31 deletion syndrome

Слайд 34Рекомендуется проводить дифференциальную диагностику с 5 синдромами: с. Прадера-Вилли, с. Ангельмана,

Велокардиофациальным с., с. Мартина-Белл, Кардиофациокутанеальным с.

Koolen-De Vries syndrome (OMIM 610443) Chromosome 17q21.31 deletion syndrome

Слайд 35Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?

ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 36МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА СИНДРОМА СОТОСА

Слайд 38ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ДИАГНОСТИКА СИНДРОМА СОТОСА
Синдром Вивера
Синдром Беквита-Видемана
Синдром Банаян-Райли-Рувалькаба
Дупликации 4p
Мозаичная трисомия 20p11.2-р12.1
Синдром делеции

22q13.3

Слайд 39Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?

ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 40ГЕННЫЙ КОНТЕНТ И РАЗМЕР CNV
Количество генов



Размер CNV

Слайд 41Включена ли CNV в базы данных нормальных вариаций?
Содержит ли CNV область,

делеция или дупликация которой является причиной известного синдрома?
Содержит ли CNV ген, делеция или дупликация которого являются причиной известных синдромов?
Каков общий генный контент или размер CNV?
Является ли обнаруженная CNV вариацией de novo?
Является ли CNV наследуемой?

ЧТО ОПРЕДЕЛЯЕТ КЛИНИЧЕСКУЮ ЗНАЧИМОСТЬ CNV?

Слайд 42CNV: НАСЛЕДУЕМАЯ ИЛИ DE NOVO?
ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ ПОЗВОЛЯЕТ ВЫЯВЛЯТЬ МИКРОДЕЛЕЦИИ…
Пациент К.,

женщина 32 г.
Беременность 21 неделя. ВПС: тетрада Фалло у плода.
Материал: амниотическая жидкость
Обнаружена микроделеция 3p26.3. Размер: 1,4 Mb

Слайд 43CNV: НАСЛЕДУЕМАЯ ИЛИ DE NOVO?

Слайд 44КЛАССИФИКАЦИЯ CNVs




CNVs



Патогенные
Непатогенные
Вариации с неизвестной клинической значимостью
LPAT
LBEN
Нет подклассификации
LPAT – вероятно патогенные
LBEN –

вероятно непатогенные

Слайд 45ПАТОГЕННЫЕ CNVs
Описаны в базах OMIM и ORPHANET как делеционный/дупликационный синдром
Описаны в

2 и более рецензируемых публикациях и/или базе DECIPHER у пациентов со сходными клиническими проявлениями


Слайд 46НЕПАТОГЕННЫЕ CNVs
CNV была описана во многих рецензируемых публикациях или курируемых базах

данных, как непатогенная, особенно если ее генетическая природа хорошо описана и/или если она является распространённым полиморфизмом

Слайд 47CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, ВЕРОЯТНО ПАТОГЕННАЯ
CNV описана в единственной рецензируемой

публикации, но с чёткими границами и фенотипом, соответствующими наблюдаемым у пациента.
CNV описана как вероятно патогенная в рецензируемых публикациях и базах данных у пациентов со сходными клиническими проявлениями
В регионе CNV имеется ген с известной функцией, нарушение которой может привести к клиническим проявлениям, сходным с наблюдаемыми у пациента.

Слайд 48CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, ВЕРОЯТНО НЕПАТОГЕННАЯ
В районе CNV отсутствуют гены

(но она была включена в отчёт по причине большого размера относительно стандартов лаборатории, либо по причине наличия другой CNV, вместе с которой она может иметь большую клиническую значимость, например, сочетание терминальной делеции и дупликации негомологичных хромосом).
CNV присутствует у небольшого количества индивидов в общепопуляционных базах данных, но не является распространённым полиморфизмом.

Слайд 49CNVs С НЕИЗВЕСТНОЙ КЛИНИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТЬЮ, НЕТ ПОДКЛАССИФИКАЦИИ
CNV содержит гены, однако неизвестно,

чувствительны ли они к изменению числа копий;
CNV представлена во многих противоречащих друг другу публикациях и/или базах данных, из-за чего невозможно сделать вывод о ее клинической значимости.

Слайд 50НЕОЖИДАННЫЕ КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ, НЕ ОТНОСЯЩИЕСЯ К ПРИЧИНЕ НАПРАВЛЕНИЯ
Носительство CNVs, связанных

с рецессивными заболеваниями
Носительство CNVs, связанных с заболеваниями с поздним началом или не диагностированными состояниями
Носительство вариантов, ассоциированных с риском неоплазии

Слайд 51НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С РЕЦЕССИВНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ
Обнаружена мутация в гене, связанном с

хорошо описанным в литературе рецессивным заболеванием с достаточно высокой частотой встречаемости в популяции, к которой относится пациент, и/или при котором доступны альтернативные методы диагностики (например, муковисцидоз).
Обнаружена мутация в гене, связанном с рецессивным заболеванием с симптоматикой, совпадающей с имеющейся у пациента.

Слайд 52НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ С ПОЗДНИМ НАЧАЛОМ
Сообщать или нет?
Может

ли пациент принимать такое решение?
Если сообщать, то о каких именно состояниях?

Слайд 53НОСИТЕЛЬСТВО CNVs, СВЯЗАННЫХ С РИСКОМ НЕОПЛАЗИИ
Сообщать или нет?
Какие варианты могут быть

включены в отчет?

Слайд 54ИНТЕРПРЕТАЦИЯ ВНЗ






Вариации с неизвестной клинической значимостью
Обследование родителей
Родитель не носитель
Родитель носитель
Здоров
Болен
Неполная пенетрантность
Варьирующая

экспрессивность
Эффекты импринтинга
Мозаицизм у родителя

CNV вероятно патогенная или
CNV и болезнь наследуются независимо

CNV вероятно патогенная

Слайд 55Пациентка Р., 3 года Клинический диагноз: Буллезный эпидермолиз, простая форма в сочетании

с костной патологией Обнаружено большое количество протяженных участков с потерей гетерозиготности (˃3 млн. п.н.) – 5,4%

Слайд 56ФЕНОТИП ПАЦИЕНТА
Фенотип синдромов попа-дающих в зону потери гетерозиготности
=


=>
Анализ мутаций связанных с

рецессивными заболеваниями

Мутации в области потери гетерозиготности могут быть причиной аутосомно-рецессивных заболеваний

Слайд 57Пациентка Р., 3 года Клинический диагноз: Буллезный эпидермолиз, простая форма в сочетании

с костной патологией Обнаружено большое количество протяженных участков с потерей гетерозиготности (˃3 млн. п.н.) – 5,4%

Слайд 58ЗАПИСЬ РЕЗУЛЬТАТОВ ХРОМОСОМНОГО МИКРОМАТРИЧНОГО АНАЛИЗА
arr(1-22)x2,(X,Y)x1 – норма, мужской пол
arr(1-22,X)x2 – норма,

женский пол
arr[hg19] 7p21.1p14.1(16817164_40301877)x3
arr – array, указывает на то, каким методом был выполнен анализ
[hg19] – версия референсного генома
7p21.1p14.1 – локализация точек разрывов
(16817164_40301877) – геномные координаты
х3 – число копий в анализируемой области

Слайд 59ПОКАЗАНИЯ К ХМА

Слайд 60ХМА В ПОСТНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ
ХМА является тестом первой линии в постнатальной диагностике

причин МВПР с задержкой развития или без нее при отсутствии у пробанда признаков известных хромосомных, моногенных и других синдромов.

Слайд 61РАСПРЕДЕЛЕНИЕ CNVs ПО РАЗМЕРУ (пациенты с МВПР, ЗР, МАР)
МВПР – множественные врожденные

пороки развития
ЗР – задержка развития
МАР – малые аномалии развития

Слайд 62КЛАССИФИКАЦИЯ CNV В РАЗЛИЧНЫХ ГРУППАХ ПАЦИЕНТОВ
МВПР – множественные врожденные пороки развития
ЗР

– задержка развития
МАР – малые аномалии развития

Слайд 63ЧАСТОТА НЕКОТОРЫХ СИНДРОМОВ В ГРУППЕ ИЗ 3299 ПАЦИЕНТОВ

Слайд 64КАК СДЕЛАТЬ ПРАВИЛЬНЫЙ ВЫБОР?

Слайд 65Сбалансированные хромосомные перестройки (транслокации, инверсии)
Ожидаем ли мы увидеть сбалансированную перестройку у

пробанда с МВПР?
Точковые мутации
Болезни экспансии тринуклеотидных повторов
Микроделеции/микродупликации, размер которых меньше разрешающей способности микроматрицы

ОГРАНИЧЕНИЯ МЕТОДА

Слайд 66НЕТ!
НУЖНО ЛИ ПОДТВЕРЖДАТЬ РЕЗУЛЬТАТЫ ХМА?
Система Геноскан 3000 является единственной апробированной полногеномной

технологией и оборудованием, которое используется для молекулярно-цитогенетического анализа, сертифицировано и имеет разрешение к применению для диагностических целей.


Слайд 67

Клинический экзом
Тщательное прочтение избранных участков по разумной цене за счет отказа

от анализа >99.5% генома.

Метод создан для выявления точковых мутаций в кодирующих участках ~4800 генов.

Детекция некоторых хромосомных перестроек – побочное применение метода с существенными ограничениями

ХМА

Метод создан для выявления хромосомной аномалии.

Охват практически 100% генома, надежная детекция любых перестроек в тщательно валидированных пределах чувствительности

Не выявляет точковые мутации









Из генома извлекаются участки экзонов с помощью сложной процедуры

Остальные 99.5% участков ДНК отмываются и не анализируются

Максимально равномерный анализ
100% хромосомной ДНК

Клинический экзом и ХМА: различные задачи и принципы методов

Слайд 68Плотность анализируемых участков в клиническом экзоме не соответствует даже самому дешевому

варианту ХМА; их распределение крайне неравномерно

Клинический экзом – 62 309 отрезков

Полный экзом – 214 115 отрезков

ХМА «Оптима» – 166 468 точек

ХМА «Стандартный» – 750 436 точек

ХМА «Расширенный» – 2 696 550 точек

Разрывы до нескольких млн. п. о.

с. Вольфа-Хиршхорна (del4p; различные образцы), chr4

п.о.

Слайд 69Эффективность выявления CNV в полноэкзомных данных по сравнению с ХМА
(сравнение программных

алгоритмов) [Parker et al., 2016]

Специфичность

(доля находок в полном экзоме, подтвердившихся при использовании ХМА)

Чувствительность

(доля находок ХМА, детектированных и в полном экзоме)

Максимальные значения – чувствительность 80.9% / специфичность 57.1% для программы ExomeDepth и 65.4% / 78.4% для CLAMMS.

Из анализа исключены все аберрации, не затронувшие хотя бы 1 экзон.
Учитывая, что в клиническом секвенировании экзома анализу подвергается в 4 раза меньше генов, полученные величины для КСЭ были бы гораздо меньше.

Packer JS, et al. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):133-5.

Слайд 70 Секвенирование экзома, хотя уже подтвердило свою высокую эффективность в выявлении точковых

мутаций, пока является сравнительно новым методом, где только предстоит выработка национальных рекомендаций. В общепризнанных рекомендациях ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics; Rehm et al., 2013) метод в принципе не рассматривается с точки зрения детекции хромосомных микроперестроек.
ХМА, напротив, давно признан «золотым стандартом» молекулярной цитогенетики, как за рубежом, так и в России; в частности, МГНЦ РАМН в 2015 г. опубликовано описание медицинской технологии «Использование хромосомного микроматричного анализа для повышения эффективности медико-генетического консультирования».
Это значит, что даже при успешной детекции аберраций с помощью NGS их необходимо обязательно подтверждать референсным методом для постановки диагноза – в случае совсем крупных делеций или дупликаций таковым может послужить кариотип, но в большинстве случаев подтверждающим методом будет выступать ХМА.

Слайд 71ГЕНЕТИЧЕСКОЕ КОНСУЛЬТИРОВАНИЕ ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ХМА
ПРОБЛЕМЫ

Назначения врача не выполняются
Завышенные ожидания от результатов

анализа
Пациенты получают результаты исследования до того, как с ними может ознакомиться врач
Нарушение требований к подготовке заключений
Незнание или непонимание содержимого заключения

Слайд 72ГЕНЕТИЧЕСКОЕ КОНСУЛЬТИРОВАНИЕ ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ХМА
ОСОБЕННОСТИ

Некоторые патогенные CNV наследуются
Могут иметь неполную пенетрантность
Выявление

CNV с неизвестной клинической значимостью требует проведения дополнительных обследований
Выявление патогенных CNV у пробанда – основание для рекомендации пренатальной диагностики
Ложное отцовство, ВРТ с донорскими клетками

Слайд 73НАСЛЕДСТВЕННЫЕ СИНДРОМЫ И ОСЛОЖНЕНИЯ АНЕСТЕЗИИ (Merlin G. Butler et al. «Specific

Genetic Diseases at Risk for Sedation/Anesthesia Complications» Anesth Analg 2000;91:837–55)

Слайд 74ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ
ПОКАЗАНИЯ
Высокий риск ХП по результатам НИПТ


Ребенок с хромосомной патологией в семье
Носительство сбалансированной хромосомной перестройки у одного из родителей
Высокий риск ХП по результатам скрининга
УЗ-маркеры ХП
ВПР плода

ВОЗМОЖНОСТИ
Анеуплоидии, триплоидии
Микроделеции/микродупликации
Несбалансированные транслокации
Потеря гетерозиготности, ОРД

Слайд 75ХМА в качестве замены анализа кариотипа рекомендован при выявлении пороков развития

плода или мертворождении
врач должен обсудить преимущества и ограничения анализа кариотипа и ХМА с пациентами, которым показана инвазивная процедура
проведение пре- и посттестового консультирования должен проводить врач, имеющий опыт в интерпретации результатов ХМА

пациенты должны быть информированы об ограничениях ХМА, а также о возможности выявлять признаки родства родителей
при выявлении ВНЗ рекомендована консультация эксперта имеющего доступ к базам данных для выявления генотип-фенотипических корреляций
не рекомендуется использование ХМА в качестве теста первой линии для диагностики причин потери беременности в первом триместре

Слайд 76ЭФФЕКТИВНОСТЬ ХМА В ПРЕНАТАЛЬНОЙ ДИАГНОСТИКЕ
УЗ-аномалии – 6%
Другие причины – 1,7%
от общего

числа случаев с нормальным кариотипом плода

УЗ-аномалии – 6,5%
Возраст старше 35 лет – 1%
Другие причины – 1,1%
от общего числа случаев с нормальным кариотипом плода


Слайд 77АНАЛИЗ CNV В ТКАНИ ОПУХОЛИ
ERBB2

Слайд 78АНАЛИЗ КАРИОТИПА, CGH ИЛИ ХМА

Похожие презентации

Хронические гепатиты 184
Язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки 473
Биоценоз влагалища 699
Острое воспаление 574
Генетическая инженерия человека. Евгеника. (Тема 5) 299
Хроническая ишемия мозга 236

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.

Для правообладателей

Яндекс.Метрика