Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства dipsacaceae juss презентация

Методология поиска геномной информации Для поиска частичных последовательностей тРНКLeu гена хлоропластов S. ochroleuca и S. columbaria нами использовался Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), предоставляющий доступ к геномной информации. Ляхова У.А. Выравнивание

Слайд 1ВЫРАВНИВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ СЕМЕЙСТВА DIPSACACEAE JUSS.
Авторы: Ляхов П.А.,
Ляхова У.А., Валуева

М.В.

Докладчик: Ульяна Ляхова,
студентка 4 курса группы БИО-б-о-14-2, специальности 06.03.01 – биология очной формы обучения

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение
высшего профессионального образования
«СЕВЕРО-КАВКАЗСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ»


Слайд 2Методология поиска геномной информации
Для поиска частичных последовательностей тРНКLeu гена хлоропластов S.

ochroleuca и S. columbaria нами использовался Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), предоставляющий доступ к геномной информации.

Ляхова У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства Dipsacaceae Juss.

Scabiosa ochroleuca

Scabiosa columbaria


Слайд 3Морфологическое сравнение исследуемых видов
Ляхова У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства Dipsacaceae

Juss.

Scabiosa ochroleuca

Scabiosa columbaria

В морфологическом плане выбранные виды имеют отличие лишь в окрасе соцветий. Более точно увидеть сходства и различия видов можно при помощи изучения и сравнения генетических последовательностей хлоропластов.


Слайд 4Выравнивание выбранных последовательностей
При выравнивании использовалась точечная матрица

, элементы которой определяются следующей формулой:

Ляхова У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства Dipsacaceae Juss.


Для поиска совпадающих участков необходимо искать все возможные случаи, когда одновременно.


Выравнивание S. ochroleuca (по горизонтали) и S. columbaria (по вертикали)


Слайд 5Фильтрация заданными порогами совпадений участков
Ляхова У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства

Dipsacaceae Juss.

Выравнивание S. ochroleuca (по горизонтали) и S. columbaria (по вертикали) с заданными порогами совпадений участков последовательностей: (А) 5 элементов; (Б) 10 элементов; (В) 20 элементов; (Г) 80 элементов


Слайд 6Заключение
При проведенном анализе можно сделать вывод что выбранные частичные последовательности тРНКLeu

генов хлоропластов S. ochroleuca и S. columbaria имеют идентичные участки нуклеотидов до 105 оснований в длину подряд. Все это свидетельствует о схожем строении хлоропластов исследуемых видов, а также о их близком родстве. Вероятно, у данных видов имеется общий предок, от которого путем мутаций произошли S. ochroleuca и S. columbaria.

Ляхова У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства Dipsacaceae Juss.


Слайд 7Благодарю за внимание!
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение
высшего профессионального образования
«СЕВЕРО-КАВКАЗСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ»


Ляхова

У.А. Выравнивание генетических последовательностей представителей семейства Dipsacaceae Juss.

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика