Реплікація, транскрипція РНК-вмісних вірусів презентация

транслюється

Вірусна РНК транскрибується в (+)sense РНК

РНК неінфекційна

В складі віріона обов’язково присутня
РНК-залежна РНК-полімераза

Більшість, але не всі віруси мають суперкапсидну оболонку

РНК компетентна для транскрипції після роздягання; утворюється 5-10 дискретних мРНК, отримані синтезом з одного промотора

Реплікація: утворюється повнорозмірна (+) РНК, що слугує шаблоном для геномів-потомків. Повинна проходити крізь stop-start сигнали; ключове рішення відбувається в межах лідерної послідовності.

складі віріону

M (matrixprotein), G, та L (поверхневі білки).епсілон представляє нетранслюємий регіон 39 нп(pseudogene).
B). Організація геному “химерних” вірусів

Організація геному вірусу сказу

матриксного білку (M), глікопротеїну (G) та РНКзРНКп (L) розділені регуляторними послідовностями, що влючають “ transcription stop” (“gene end”) сигнал, сигнал поліаденілювання, нетранслюючий міжгенний (“intergenic”) регіон та сигнал старту транскрипції ( “transcription start” (“gene start”) . Транскрипційна одинця фланкована лідерною (Le) та кіцевою (“trailer” (Tr) послідовностями. Зверніть увагу, що геном показаний від 3’ до 5’ кінця.
From Neumann et al., J. Gen Virol. DOI 10.1099/vir.0.18400-0

(РНК, зв’язана з N-білком)
Всі мРНК ВВС кеповані і поліаденільовані
Лідерна РНК (48 нп) не кепується і не поліаденілюється

регіон (Le) лідера і гени N і P. Протягом транскрипції RDRP, комплекс L (великий овал) і trimer P (маленький овал), зв'язуються із специфічними послідовностями і ініціюють старт синтезу гену N. Продуктом цієї реакції є мРНК генів N і P ВВС. 5-термінальний кеп зображений чорним трикутником, а 3' кінець polyA(n). Протягом реплікації RDRP ініціюється в 3' кінці генома. Реплікація потребує, щоб синтез забезпечував протеїн N для енкапсидації виникаючої РНК. Протеїн N(штрихований овал) утримується в розчинній взаємодії з P, в співвідношенні 2:1. Позиції ініціації вказуються чорними трикутниками.

From Whelan and Wertz, 2002, PNAS 99: 9178-9183

  Модель синтезу РНК ВВС

virus:
HN - haemagglutinin + neuraminidase activities; Measles - referred to as H protein - no neuraminidase activity; RSV - G protein - neither activity.
F - consists of 2 disulphide-linked subunits (F1 + F2) - responsible for cell fusion + haemolytic function.
Other proteins: The M (matrix) protein lines the inner surface of the envelope. NP - nucleoprotein. L and P - polymerase activity
Глікопротеїни - не утворюють такі видатні спайки як на вірус грипу: HN - гемаглютиніну + нейрамінідази діяльності; Кір - називають білка H - не нейрамінідази діяльності; RSV - G білка - ні активності. F - складається з 2-дисульфід-пов'язаних субодиниць (F1 + F2) - відповідає за злиття клітин + гемолітичної функції. Інші білки: M (матриця) білка лінії внутрішньої поверхні конверта. NP - нуклеопротеїдів. L і P - полімеразної активності

From Alan Cann website

Paramyxoviridae

ініціація транскрипції
(30-60 копій на віріон)

Гемаглютинін; головна антигенна детермінанта; рецептор
(500 копій на віріон)

Компонент РНК-транскриптази; елонгація транскрипції
(30-60 копій на віріон)

Нейрамінідаза; поверхневий глікопротеїд
(100 копій на віріон)

Компонент РНК-транскриптази; рибонуклеопротеїд
(1000 копій на віріон)

Матриксний білок; (3000 копій на віріон)
Неструктурний білок; функція невідома

Неструктурний білок; функція невідома
Неструктурний білок; функція невідома

1. 2341 bp

2. 2341 bp

3. 2233 bp

4. 1778 bp

5. 1565 bp

6. 1413 bp

7. 1027 bp

8. 890 bp

along with the proteins it codes for.

Source: http://www.omedon.co.uk/influenza/influenza/

індивідуальних сегментів геномів відмінні
3’ –кінці геномних РНК немодифіковані; на 5’-кінці ppp (не кеп)
Транскрипція вірусної мРНК проходить з приєднанням 10-13нп фрагментів, "викрадених" (stolen) від клітинної мРНК
Перед 5’-кінецем вірусна полімераза робить паузу і повторює копіювання внутрішнього тракту U7 для додавання ~ 150 залишків до 3’-кінця мРНК копії
Геномна РНК копіюється в повнорозмірну антигеномну (+) олРНК

9345

Зворотня генетика вірусу грипу