Новосибирск - 2017
Institute of Cytology and Genetics
- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Основы количественной и эволюционной генетики презентация
Содержание
- 1. Основы количественной и эволюционной генетики
- 2. Зачем?
- 3. Примерный план на 1 часть (очень примерный)
- 4. Признаки Количественные/Качественные Сильно или слабовариативные Наследуются или не наследуются …
- 5. Качественные признаки глубоко в душе количественные
- 6. Придадим немного формализма Самый простой случай: биаллельный полиморфизм
- 7. Расщепление по одному гену
- 8. Расщепление в F2
- 9. Уходим от дискетности
- 10. Формализация модели 0 Y= G + E
- 11. Формализация модели 1
- 12. Формализация модели 2
- 13. И вот она
- 14. И дисперсии
- 15. Ключевые концепции
- 16. Дальше проще - наследуемость
- 17. Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного
- 18. Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного
- 19. Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного
- 20. Некоторые важные мисконцепции Да/Нет У конкретного
- 21. Как оценивать? В общем случае: родственная структура
- 22. Близнецовые исследования
- 23. Аддитивность и неаддитивность
- 24. Отбор Selection can change the distribution of
- 25. The Selection Differential and the Response to
- 27. The Breeders’ Equation: translating S into R
- 29. Средний эффект аллеля
- 30. Strictly speaking, the breeders’ equation only
Зачем?
Слайд 1Блок 3 (или 4?):
Основы количественной и эволюционной генетики
Яков Цепилов Александрович
кбн, нс
лаб. Теоретической и Прикладной Функциональной Геномики ИЦиГ СО РАН
Слайд 3Примерный план на 1 часть (очень примерный)
Признаки – количественные и качественные
Полигенная
модель
Наследуемость
Как измерять?
Отбор
Много признаков (чуть-чуть)
Что там у человека?
Геномная селекция
Наследуемость
Как измерять?
Отбор
Много признаков (чуть-чуть)
Что там у человека?
Геномная селекция
Слайд 4Признаки
Количественные/Качественные
Сильно или слабовариативные
Наследуются или не наследуются
…
Слайд 17Некоторые важные мисконцепции
Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его
наследуемость очень высокая!
Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Слайд 18Некоторые важные мисконцепции
Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его
наследуемость очень высокая!
Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Слайд 19Некоторые важные мисконцепции
Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его
наследуемость очень высокая!
Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Слайд 20Некоторые важные мисконцепции
Да/Нет
У конкретного индивида очень высокое значение признака, значит его
наследуемость очень высокая!
Нет, наследуемость это характеристика популяционная, не индивида!
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Наследуемость признака равна 0, значит генетика не важна для этого признака. Нет, наследуемость ничего не говорит о генетической архитектуре, только о том, какая часть генетической вариативности влияет на признак
Наследуемость этой болезни равна 1, значит попытки как-то повлиять на болезнь через среду априори безрезультатны. Нет, оценки наследуемости в другой среде могут быть совершенно другими
Слайд 21Как оценивать?
В общем случае: родственная структура – чем больше родственники похожи
по определённому фенотипу – тем больше его наследуемость
Близнецовые исследования – «лучшие»:
МБ (MZ) – 100% генов одинаковые, дисперсия только средовая
ДБ (DZ) – 50% генов общие, вклад в дисперсию признака как от генов, так и от среды
Близнецовые исследования – «лучшие»:
МБ (MZ) – 100% генов одинаковые, дисперсия только средовая
ДБ (DZ) – 50% генов общие, вклад в дисперсию признака как от генов, так и от среды
Слайд 24Отбор
Selection can change the distribution of phenotypes, and we typically measure
this by changes in mean
– This is a within-generation change
Selection can also change the distribution of breeding values
- This is the response to selection, the change in the trait in the next generation (the between generation change
– This is a within-generation change
Selection can also change the distribution of breeding values
- This is the response to selection, the change in the trait in the next generation (the between generation change
Слайд 25The Selection Differential and the
Response to Selection
The selection differential S measures
the within-generation change in the mean
S = μ* - μ
The response R is the between-generation change in the mean
R(t) = μ(t+1) - μ(t)
S = μ* - μ
The response R is the between-generation change in the mean
R(t) = μ(t+1) - μ(t)
Слайд 30
Strictly speaking, the breeders’ equation only holds for predicting a single
generation of response from an unselected base population
Practically speaking, the breeders’ equation is usually pretty good for 5-10 generations
The validity for an initial h2 predicting response over several generations depends on:
– The reliability of the initial h2 estimate
– Absence of environmental change between generations
– The absence of genetic change between the generation in which h2 was estimated and the generation in which selection is applied
Practically speaking, the breeders’ equation is usually pretty good for 5-10 generations
The validity for an initial h2 predicting response over several generations depends on:
– The reliability of the initial h2 estimate
– Absence of environmental change between generations
– The absence of genetic change between the generation in which h2 was estimated and the generation in which selection is applied
