- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Лекция 6 презентация
Содержание
- 1. Лекция 6
- 2. Основные регуляторные события (механизмы) регуляции Геном Транскриптом Протеом Метаболом Орган Организм Популяция Биосфера
- 3. Геном (прокариоты) Оперонная структура (Lac-оперон) Независимое расположение
- 4. Транспорт сахаров (лактозы)
- 5. www.kegg.org
- 7. Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот Bacillus subtilis (оперонное расположение)
- 8. Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот
- 9. Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот Mycoplasma gallisepticum (дискретное расположение)
- 10. Расположение генов гликолиза(GAPDH и ENO) у эукариот
- 11. Расположение генов гликолиза(GAPDH и ENO) у эукариот
- 12. индуктор
- 13. Сильные промоторы: хорошее соответствие консенсусу и правильный
- 14. CIRCE TTAGCACTC---NNNNNNNNN---GAGTGCTAA 9 9
- 15. сигма фактор определяет специфичность связывания РНК порлимеразы
- 16. сигма фактор узнаваемые промоторы структура промотора -35 бокс
- 17. Работа lac-оперона в клетках, содержащих нормальный геном
- 18. Репрессор состоит из нескольких субъединиц. Мутации, затрагивающие
- 19. Наряду с главным оператором (О1) в лактозном
- 20. Репресор не препятствует связыванию РНК полимеразы с
- 21. Почему lac-оперон не работает, когда в среде
- 22. CAPстимулирует образование открытого комплекса Участок связывания CAP
- 24. Анаболитные опероны Должны активироваться в условиях недостатка
- 25. Преждевременная остановка транскрипции (attenuation) обеспечивает дополнительную репрессию
- 27. При отсутствии триптофана рибосома задерживается на
Слайд 2Основные регуляторные события (механизмы) регуляции
Геном
Транскриптом
Протеом
Метаболом
Орган
Организм
Популяция
Биосфера
Слайд 3Геном (прокариоты)
Оперонная структура (Lac-оперон)
Независимое расположение генов
Наличие внутри оперона дополнительных регуляторных элементов
Разнообразие
Слайд 6
ADP
ATP
NADH
NAD+
ADP
ATP
ADP
ATP
ADP
ATP
-1 АТФ/моль глюкозы
-1 АТФ/моль глюкозы
+2 АТФ/моль глюкозы
+2 АТФ/моль глюкозы
Глюкоза
Глюкозо-6-фосфат
Фруктозо-6-фосфат
Фруктозо-1,6-бифосфат
Дигидроксиацетон-фосфат
Глицеральдегид-3-фосфат
1,3-дифосфоглицерат
3-фосфоглицерат
2-фосфоглицерат
Фосфоенол-пируват
Пируват
+2 НАДН/моль глюкозы
1
2
3
5
6
7
8
9
10
4
4
Слайд 7Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот
Bacillus subtilis (оперонное расположение)
Слайд 8Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот
Mycoplasma gallisepticum (дискретное расположение)
gapA
Enolase
Слайд 9Расположение генов гликолиза(gapA и eno) у прокариот
Mycoplasma gallisepticum (дискретное расположение)
Слайд 13Сильные промоторы: хорошее соответствие консенсусу и правильный спейсинг
Слабые промоторы: существенные отличия
Структура промоторов Е. Coli
Pribnow box
TATA box
-10 box
Слайд 14CIRCE
TTAGCACTC---NNNNNNNNN---GAGTGCTAA
9
9
9
N
N N
N
N N
N N
C-G
T-A
C-G
A-T
C-G
G-C
A-T
T-A
T-A
NNNNN NNNNN
NNNNN NNNNN
A-T
A-T
T-A
C-G
G-C
T-A
G-C
A-T
G-C
N N
N N
N N
N N
N
N
N N
N N
N N
N N
C-G
T-A
C-G
A-T
C-G
G-C
A-T
T-A
T-A
NNNNN NNNNN
HrcA
Слайд 15сигма фактор определяет специфичность связывания РНК порлимеразы с промоторами
Сравнение аминокислотных последовательностей
четырех консервативных участков
участок 1 – подавление неспецифического связывания свободного сигма фактора с ДНК
участок 2 (наиболее консервативный) – связывание с -10 боксом промотора
участок 3 - (факультативный) связывание с -10 боксом промотора
участок 4 – связывание с -35 боксом промотора
E.Coli
B. Subtilis
подавление
неспецифического
связывания РНК пол
с ДНК
У Subtilis эту
функцию выполняет
другой белок
Слайд 16сигма фактор узнаваемые промоторы структура промотора -35 бокс
σ70 Большинство генов TTGACAT TATAAT σ32 Гены, активирующиеся при тепловом шоке TCTCNCCCTTGAA CCCCATNTA σ28 Гены подвижности и хемотаксиса CTAAA CCGATAT σ38 Гены стационарной фазы и ответа на стрессы ? ?
-24 Region -12 Region σ54 Гены метаболизма азота CTGGNA TTGCA
Слайд 17Работа lac-оперона в клетках, содержащих нормальный геном и частичную
копию генома с
есть репрессор,
работающий
in trans
есть
cis-регуляторный
элемент, мутации
в котором
препятствуют
связыванию
trans-репрессора
Слайд 18Репрессор состоит из нескольких субъединиц. Мутации, затрагивающие одну
субъединицу, влияют на способность
индуктором, либо с оператором
Слайд 19Наряду с главным оператором
(О1) в лактозном опероне есть
два «вспомогательных» оператора
(О2 и
значительно снижается, если
делетировать одновременно О2 и О3
тетрамер репрессора связывается одновременно с двумя участками
узнавания на молекуле ДНК
ДНК
Слайд 20Репресор не препятствует связыванию РНК полимеразы с промотором
Репрессия осуществляется на этапе
к элонгации
Слайд 21Почему lac-оперон не работает, когда в среде есть и глюкоза и
Катаболитная репрессия ?
В действительности - активация
CAP – Catabolite Activator Protein
(активатор катаболитных оперонов)
Работает в комплексе с цикло-АМФ,
уровень которого существенно
повышается при недостатке глюкозы
CAP активирует целый ряд оперонов, обеспечивающих синтез ферментов,
необходимых для использования альтернативных продуктов питания
(gal, галактозный оперон; ara, арабинозный оперон)
Слайд 22CAPстимулирует образование открытого комплекса
Участок связывания CAP находится перед промотором и содержит
Lac промотор и многие другие катаболитные промоторы являются очень слабыми. -35 бокс в этих промоторах сильно отличается от консенсуса
Существуют мутанты laс промотора, которые обеспечивают транскрипцию без САP активатора
Слайд 24Анаболитные опероны
Должны активироваться в условиях
недостатка тех веществ, в синтезе
которых участвуют кодируемые
опероном ферменты
триптофановый оперон:
триптофан (корепрессор) связывается
с неактивной формой репрессора,
превращая ее в активную
Слайд 25Преждевременная остановка транскрипции (attenuation) обеспечивает
дополнительную репрессию
В начале оперона находится короткая ORF,
лидерный пептид
После этой рамки считывания находится сигнал терминации транскрипции
Слайд 27
При отсутствии триптофана рибосома задерживается на лидерной последовательности.
Это смещает равновесие в
У прокариот транскрипция и трансляция могут происходить одновременно
Регулируемые терминаторы транскрипции есть и в других анаболитных оперонах
В гистидиновом опероне лидер содержит 7 кодонов гистидина
