- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Хиральность молекул. Определение абсолютной структуры. презентация
Содержание
- 1. Хиральность молекул. Определение абсолютной структуры.
- 2. План занятия Хиральность молекул и определение абсолютной
- 3. Хиральность Хиральность (от греческого ceir - рука)
- 4. S(+)-карвон – запах тмина и укропа R(-)-карвон
- 5. … менее упоминаемые примеры D-амфетамин – стимулятор
- 6. Методы определения абсолютной структуры
- 7. Методы определения абсолютной структуры
- 8. Определение абсолютной структуры – величина аномального рассеяния
- 9. Методы определения абсолютной структуры Bijvoet method (J.M.
- 10. Flack x parameter –определение и смысл
- 11. H.D. Flack & G. Bernardinelli J. Appl.
- 12. Запись в CIF _chemical_absolute_configuration rm -
- 13. Пример 1 Цистеин C3H7NO2S
- 14. Пример 2
Слайд 1Хиральность молекул. Определение абсолютной структуры.
Методы кристаллоструктурных исследований
Слайд 2План занятия
Хиральность молекул и определение абсолютной структуры.
Примеры определения абсолютной структуры.
Подготовка CIF
для одного из примеров.
Слайд 3Хиральность
Хиральность (от греческого ceir - рука) – свойство объекта быть несовместимым
со своим зеркальным отражением любой комбинацией вращений и перемещений в трёхмерном пространстве.
Соотношение в природе 20000:1 !
Слайд 4S(+)-карвон – запах тмина и укропа
R(-)-карвон – запах мяты
(S)-талидомид – тератогенный
(R)-талидомид – седативный
Рацемизация происходит в физиологических условиях!
~10000 жертв
Различная активность хиральных соединений: упоминаемые примеры
Слайд 5… менее упоминаемые примеры
D-амфетамин – стимулятор ЦНС
L-амфетамин – стимулятор ПНС
D-первитин –
стимулятор ЦНС
L- первитин – стимулятор ПНС
L- первитин – стимулятор ПНС
L-меторфан – опиоид-анальгетик
D-меторфан – диссоциативное средство для облегчения кашля.
Слайд 8Определение абсолютной структуры – величина аномального рассеяния
Ag-Kα = 0.55000 Å
Mo-Kα =
0.71073 Å
Cu-Kα = 1.54178 Å
Cr-Kα = 2.28962 Å
Cu-Kα = 1.54178 Å
Cr-Kα = 2.28962 Å
и зависят от типа атомов
и длины волны
Слайд 9Методы определения абсолютной структуры
Bijvoet method (J.M. Bijvoet, 1951)
J.M. Bijvoet, A.F. Peerdeman,
A.J. van Bommel; Nature 168 (1951) 271-273
Flack parameter (H.D. Flack, 1983)
H.D. Flack; Acta Crystallogr. A39 (1983) 876-881
H.D. Flack, G. Bernardinelli; J. Appl. Cryst. 33 (2000) 1143-1148
Q-value method (S. Parsons, 2004)
Simon Parsons & Howard Flack
Precise Absolute Structure Determinations for Light Atom Structures ECM, Budapest, 2004
Invariom method (B. Dittrich, 2006)
B. Dittrich, M. Strümpel, T. Koritsánszky, M. Schäfer, M. A. Spackman.
Acta Crystallogr. A62 (2006), 217-223.
Bayesian statistics (Hooft & Spek, 2007)
Rob W.W. Hooft, Leo Straver & Anthony L. Spek
R.W.W. Hooft, L. H. Straver, A. L. Spek; J. Appl. Cryst. 41 (2008) 96-103
Flack parameter (H.D. Flack, 1983)
H.D. Flack; Acta Crystallogr. A39 (1983) 876-881
H.D. Flack, G. Bernardinelli; J. Appl. Cryst. 33 (2000) 1143-1148
Q-value method (S. Parsons, 2004)
Simon Parsons & Howard Flack
Precise Absolute Structure Determinations for Light Atom Structures ECM, Budapest, 2004
Invariom method (B. Dittrich, 2006)
B. Dittrich, M. Strümpel, T. Koritsánszky, M. Schäfer, M. A. Spackman.
Acta Crystallogr. A62 (2006), 217-223.
Bayesian statistics (Hooft & Spek, 2007)
Rob W.W. Hooft, Leo Straver & Anthony L. Spek
R.W.W. Hooft, L. H. Straver, A. L. Spek; J. Appl. Cryst. 41 (2008) 96-103
Слайд 10Flack x parameter –определение и смысл
Дифракционная картина рассматривается как от двойника,
состоящего из одного кристалла «нормальной» структуры и второго кристалла инвертированной структуры. Параметр x вводится как дополнительный уточняемый параметр следующей формулой:
То есть x это доля инвертированной структуры.
x = 0
x = 1
«нормальная» структура
инвертированная структура
Очень важно обращать внимание на стандартное отклонение параметра x:
Энантиомеры считаются хорошо различимыми при σ(x) < 0.04
Энантиомеры считаются приемлемо различимыми при σ(x) < 0.10
н
и
н
и
н
и
Слайд 11H.D. Flack & G. Bernardinelli J. Appl. Cryst., 33,(2000) 1143.
Flack x
parameter –определение и смысл
Слайд 12Запись в CIF
_chemical_absolute_configuration
rm - Absolute configuration established by the structure determination
of a
compound containing a chiral reference molecule of known absolute
configuration.
ad - Absolute configuration established by anomalous-dispersion effects in
diffraction measurements on the crystal.
rmad - Absolute configuration established by the structure determination of a compound containing a chiral reference molecule of known absolute
configuration and confirmed by anomalous-dispersion effects in
diffraction measurements on the crystal.
syn - Absolute configuration has not been established by anomalous-dispersion effects in diffraction measurements on the crystal. The enantiomer has been assigned by reference to an unchanging chiral centre in the synthetic
procedure.
unk - Absolute configuration is unknown, there being no firm chemical evidence for its assignment to hand and it having not been established by
anomalous-dispersion effects in diffraction measurements on the crystal. An arbitrary choice of enantiomer has been made.
. - Inapplicable.
compound containing a chiral reference molecule of known absolute
configuration.
ad - Absolute configuration established by anomalous-dispersion effects in
diffraction measurements on the crystal.
rmad - Absolute configuration established by the structure determination of a compound containing a chiral reference molecule of known absolute
configuration and confirmed by anomalous-dispersion effects in
diffraction measurements on the crystal.
syn - Absolute configuration has not been established by anomalous-dispersion effects in diffraction measurements on the crystal. The enantiomer has been assigned by reference to an unchanging chiral centre in the synthetic
procedure.
unk - Absolute configuration is unknown, there being no firm chemical evidence for its assignment to hand and it having not been established by
anomalous-dispersion effects in diffraction measurements on the crystal. An arbitrary choice of enantiomer has been made.
. - Inapplicable.
