Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура. презентация

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность

Слайд 2 Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка).


Признаки гомологичности белков
сходная 3D-структура
в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность
разные другие соображения…

Слайд 3

Гомологи

Ортологи Паралоги Ксенологи ?

(W.M.Fitch, Syst.Zool.19,99(1970)


Слайд 4Ортологи - последовательности, возникшие из одного общего предшественника в процессе

видообразования. Ортологи, как правило, имеют одну и ту же функцию
Паралоги - последовательности, возникшие из одного общего предшественника в результате дупликации одного гена в одном организме. Паралоги, как правило, имеют разные функции.

Слайд 5«Идеальное» выравнивание – запись последовательностей одна под другой так, чтобы гомологичные

фрагменты оказались друг под другом.
Дом
Скупидом
Водомерка ?

Домов---ой Домов-----ой
Домо-строй Домо-строй


Задача выравнивания = задача поиска сходства. Сходство ≠ гомология

?

Гэп – пропуск в
последовательности


Слайд 6Гэп – пропуск в
последовательности
Как получить «оптимальное» выравнивание?
Один из способов:


Слайд 7
Мутации,
рекомбинация, ….
?


Слайд 8Example: point mutations
Silent mutation
Amino acid change
Termination
x
Frame shift


Слайд 10Domain insertion: “Mosaic proteins”



Structural modules:
plasminogen kringle domain
EGF domain
fibronectin finger domain
vit.

K-dependent calcium-binding domain (osteocalcin)






tissue plasminogen activator





urokinase












prothrombin

plasminogen

Domain origins:


trypsin-like serine protease

Mosaic proteins










fibronectin











epidermal growth factor (EGF)


Слайд 11Домен – единица
эволюции, структуры и функции белков.

Домен – компактная, относительно
независимо сворачивающаяся структура,
относительно консервативная в процессе
эволюции.
Белки могут состоять из одного или
многих доменов.

Слайд 12Бывает и такое…. (пример структурного выравнивания)


Слайд 13
AAAAAAAAAA

AACDEAAAA


Что лучше?

AAAAAAAAAA AA---AAAAAAAA
AACDE-AAAA AACDE----AAAA



Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика