Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура. презентация

Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка). Признаки гомологичности белков сходная 3D-структура в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность

Слайд 2 Гомологичные последовательности – последовательности, имеющие общее происхождение (общего предка).


Признаки гомологичности белков
сходная 3D-структура
в той или иной степени похожая аминокислотная последовательность
разные другие соображения…

Слайд 3

Гомологи

Ортологи Паралоги Ксенологи ?

(W.M.Fitch, Syst.Zool.19,99(1970)


Слайд 4Ортологи — последовательности, возникшие из одного общего предшественника в процессе

видообразования. Ортологи, как правило, имеют одну и ту же функцию
Паралоги — последовательности, возникшие из одного общего предшественника в результате дупликации одного гена в одном организме. Паралоги, как правило, имеют разные функции.

Слайд 5Гэп – пропуск в
последовательности
Задача выравнивания = задача поиска сходства. Сходство

— не то же, что гомология!

Слайд 6 «Идеальное» выравнивание – запись последовательностей одна под другой так, чтобы гомологичные

фрагменты оказались друг под другом.
домовой скупидом водомерка ?
лесовоз ---лесо---воз ледоход лед---оход---

?

Гэп – пропуск в
последовательности


Слайд 7Схожие 3D структуры
Вставка в «синей» последовательности


Слайд 8
Мутации,
рекомбинация, ….
?


Слайд 9Точечные мутации
“Молчащая”
Замена остатка
Терминация

ATA TGT ATA AAG GCA AAC TCC

TGT TAA AC

Ile Cys Ile Lys Ala Asn Ser Cys Stop

x

Сдвиг рамки


Слайд 10

Конверсия гена:
“Non-reciprocal recombination“

Рекомбинация

Кроссинговер:
“Reciprocal recombination“

2:2
3:1


Слайд 11
25 белков
9 белков
2 белка
12 белков
223 белка
243 белка
507

белков

ЕС 2.5.1.15

ЕС 4.1.2.25

ЕС 2.7.6.3

Домены и многодоменные белки


Слайд 12Домен – единица эволюции, структуры и функции белков.

Домен – компактная, относительно
независимо

сворачивающаяся структура,
относительно консервативная в процессе
эволюции.

Белок может состоять из одного или
многих доменов.

Слайд 13Бывает и такое…. (пример структурного выравнивания)


Слайд 14
AAAAAAAAAA

AACDEAAAA


Что лучше?

AAAAAAAAAA AA---AAAAAAAA
AACDE-AAAA AACDE----AAAA



Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика