- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Геномы и эволюция презентация
Содержание
- 1. Геномы и эволюция
- 2. Из записной книжки Дарвина, 1837
- 3. Испорченный телефон
- 4. Испорченный телефон
- 5. Испорченный телефон
- 6. Испорченный телефон
- 7. Эволюция белков / генов
- 8. Эволюция белков / генов
- 9. Эволюция белков / генов
- 10. Эволюция белков / генов
- 11. Эволюция белков / генов
- 12. Эволюция белков / генов
- 13. Филогенетические деревья Идея, по-видимому, Крика
- 14. Примерно первое дерево белков
- 15. Типичное дерево (родопсины)
- 16. Молекулярная палеонтология Реконструированный белок и его свойства
- 17. Эпидемиология (вирусов)
- 18. Устойчивость бактерий к антибиотикам мутации в гене бета-лактамазы, устойчивость к цефотаксиму (цефалоспорин 3-го поколения)
- 19. Эволюция белков за счет перестановок доменов
- 20. Еще об эволюции белков Источники новых последовательностей
- 21. От генов к видам Деревья для разных
- 22. «Принцип Пирсона» консервативно => важно гены регуляторные участки
- 23. Один и тот же ген в нескольких
- 24. rbsD в энтеробактериях Sty AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC Sen AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
- 25. rbsD в энтеробактериях Sty AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC Sen AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
- 26. FNR, DnaA, NrdR регулируют nrdD
- 27. Эволюция за счет изменений регуляции Лактаза
- 28. Следы эволюционных событий ретровирусы и т.п. (полно)геномные
- 29. Сайт есть – регулятора нет потеря
- 30. Неоднократные потери и возвращения крыльев в ходе эволюции палочников
- 31. Скорость эволюции. Положительный и отрицательный отбор
- 32. Обезьяна -> человек Изменения регуляции и уровней
- 33. Происхождение жизни «Эволюция» как метафора может использоваться
Слайд 13Филогенетические деревья
Идея, по-видимому, Крика
Эмануэль Марголиаш (1963)
цитохром с (104 аминокислоты). Число замен:
лошадь–свинья
первая реализация – Полинг и Цукеркандль
Кимура (1977): большинство замен нейтральны
Слайд 18Устойчивость бактерий к антибиотикам
мутации в гене бета-лактамазы, устойчивость к цефотаксиму (цефалоспорин
Слайд 20Еще об эволюции белков
Источники новых последовательностей («строительного материала»):
доменные перестановки
дупликации
захват некодирующих последовательностей
Изменение
кристаллины
дельта-кристаллин (прицы и рептилии) – аргининосукцинат лиаза
зета-кристаллин (нек. группы млекопитающих) – хинон-редуктаза
альфа-кристаллин – белок теплового шока
эпсилон-кристаллин (птицы) – лактат-дегидрогеназа
тау-кристаллин (птицы) – альфа-энолаза
s-кристаллин (головоногие) – глутатион-S-трансфераза
эта-кристаллин (слоновые землеройки) – альдегид-дегидрогеназа
ро-кристаллин (лягушки) – альдо-кето редуктаза
антифризы
регулярные повторы, источник не важен
Слайд 21От генов к видам
Деревья для разных семейств генов похожи.
Эти деревья согласуются
Стало быть, используемые эволюционные модели адекватны и их можно использовать для заполнения лакун в палеонтологической летописи и уточнения таксономии.
неоднократное возникновение многоклеточности и т.п.
переоценка роли морфологических признаков
Полеонтологичевская летопись дает калибровку по времени.
Слайд 23Один и тот же ген
в нескольких геномах
Sty TCGCTCG--CAGCGGAAAGAGGATTACGCCCTTCGCCTGGAGGCTGTGCAGGGGC---GCCGGAGATGGGATGCATAATT
Stm TCGCTCG--CAGCGGAAAGAGGATTACGCCCTTCGCCTGGAGGCTGTGCAGGGGC---GCCGGAGATGGGATGCATAATT
Sen TCGCTCG--CAGCGGAAAGAGGATTACGCCCTTCGCCTGGAGGCTGTGCAGGGGC---GCCGGAGATGGGATGCATAATT
Eco TTGCCCG--TGCCAGACGGCAGATTATCTCCCTGACCTGGTGGTTGCCCAGGAGGAGGGCCGGAAATAGGTTGTATCATT
Kpn
Ype TTGTTAGAACAGGGGAAAACGGTAAACAGTGTGGCATTAGATGTCGGTTATAGCT-----CCGCCTCTGCTTTTATCGCC
* * * * * * * * * * *
Sty AATTATCCTTTAAC----------CATAAATCTGAGCAATA-TATGCTTGGCGGCCAGATTATGGC--ACACTTGTCCGG
Stm AATTATCCTTTAAC----------CATAAATCTGAGCAATA-TATGCCTGGCGGCCAGATTATGGC--ACACTTGTCCGG
Sen AATTATCCTTTAAC----------CATAAATCTGAGCAATA-TATGCCTGGCGGCCAGATTATGGC--ACACTTGTCCGG
Eco ACGTATCCTTATAC----------CTGAAATCTTCGCAAG--TATGCCTGGCCGCGAGATTATGGC--ACACTTGTCCGG
Kpn ATTCATCCTTTCGATATCGCGGTGCTGGAACCAGGTGATGAGTATGCCTGGCGGCCAGATTATGGC--ACACTTCCCCAG
Ype ATGTTTCAGCAAATAT--------CGGGTACCA-CGCCTGAGCGTTTCCGGCGGGGCAATAGTGGCTTATACTAAGCCCC
* ** * * * * *** * ** **** * *** **
Sty TTAACTCTCGTT-CTCAAACAG------GTACGACAGTC--GTGAAAATTCTCGTTGATGAAAATATGCCTTACGCCCGC
Stm TTAACTCTCGTT-CTCAAACAG------GTACGACAGTC--GTGAAAATTCTCGTTGATGAAAATATGCCTTACGCCCGC
Sen TTAACTCTCGTT-CTCAAACAG------GTACGACAGTC--GTGAAAATTCTCGTTGATGAAAATATGCCTTACGCCCGC
Eco TTAACTCTCGT--CTCATACAG------GTAACACAAAC--GTGAAAATCCTTGTTGATGAAAATATGCCTTATGCCCGC
Kpn TTAACTCTCGTT-CTCAGACAG------GTACTGAACT---GTGAAAATCCTCGTTGATGAAAATATGCCCTATGCCCGT
Ype CTGTTTTTCATCTGTATGGCAGTTCGCTGTCGGAGAGTAAAGTGAAAATTCTGGTTGATGAAAATATGCCGTACGCTGAG
* * ** * * *** ** * ******** ** ***************** ** **
123123123123123123123123123123123123123
Гены консервативнее, чем межгенные области
(точнее, особенности эволюции другие)
Слайд 24rbsD в энтеробактериях
Sty AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Sen AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Stm GGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Eco AGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAA-AAAAATGAAAAAAGGC
Ype TTTTCTAAACTCCTTGTTAGCGAAACGTTTCGCTCTTGGAGTA-GATCATGAAAAAAGGT
Sty ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Sen ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Stm ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Eco ACCGTTCTTAATTCTGATATTTCATCGGTGATCTCCCGTCTGGGACATACCGATACGCTG
Ype GTATTACTGAACGCTGATATTTCCGCGGTTATCTCCCGTCTGGGCCATACCGATCAGATT
* ** ** **** ** ** **** ** *********** ***** *** *
Слайд 25rbsD в энтеробактериях
Sty AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Sen AGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Stm GGGGTTACACTGCGGC-CAGCGAAACGTTTCGCTAGTGGAGCAGAAAAATGAAGAAAGGC
Eco AGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAA-AAAAATGAAAAAAGGC
Ype TTTTCTAAACTCCTTGTTAGCGAAACGTTTCGCTCTTGGAGTA-GATCATGAAAAAAGGT
Sty ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Sen ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Stm ACCGTACTCAACTCTGAAATCTCGTCGGTCATTTCCCGTCTGGGGCATACTGATACTCTG
Eco ACCGTTCTTAATTCTGATATTTCATCGGTGATCTCCCGTCTGGGACATACCGATACGCTG
Ype GTATTACTGAACGCTGATATTTCCGCGGTTATCTCCCGTCTGGGCCATACCGATCAGATT
* ** ** **** ** ** **** ** *********** ***** *** *
Слайд 27Эволюция за счет изменений регуляции
Лактаза
Эксперимент: пересадка регуляторной области гена Prx1 летучей
Слайд 28Следы эволюционных событий
ретровирусы и т.п.
(полно)геномные дупликации
горизонтальный перенос генов
синонимичные замены
псевдогены
Mycobacterium leprae
RbsR в
слабовредные мутации
Слайд 29Сайт есть – регулятора нет
потеря RbsR у Y. pestis (ABC-транспортер
Start codon of rbsD
RbsR binding site
Слайд 31Скорость эволюции.
Положительный и отрицательный отбор
Разные гены эволюционируют с разной скоростью
имеющие
это следствие отрицательного отбора (против нового)
Положительный отбор: новое – хорошо
поверхностные антигены патогенов и иммунная система
рецепторы сперматозоидов и яйцеклеток
репродуктивная изоляция за счет дрейфа
видообразование
Слайд 32Обезьяна -> человек
Изменения регуляции и уровней экспрессии генов
Дупликации генов
Быстрая эволюция генов
Слайд 33Происхождение жизни
«Эволюция» как метафора может использоваться при обсуждении любой стадии происхождения
но это не очень поучительно
Естественный отбор начинается, когда появляются репликаторы (самовоспроизводящиеся структуры)
Что можно сказать о LUCA?
РНКовый геном
неоднократное изобретение (заимствование у вирусов?) аппарата транскрипции и репликации ДНК
трансляция (рибосомы, тРНК, аминоацил-тРНК-синтетазы)
генетический код
что-то о метаболизме
был ли он клеткой??
двукратное изобретение клеточных мембран
LECA, LBCA, LACA
происхождение эукариот
