- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Эволюция геномов презентация
Содержание
- 1. Эволюция геномов
- 2. Статус гена в геноме PPI – количесто
- 3. Гены и геномы - деревья Дерево генов
- 4. Задача согласования деревьев «вложение» дерева видов в
- 5. Альтернативные подходы к идентификации горизонтальных переносов Не
- 6. примеры По горизонтали – расстояние между геномами
- 7. Геномные перестановки
- 8. Полногеномные дупликации
- 9. Дрожжи
- 11. Можно обойтись без пар
- 12. Влияние внутри-геномных перестановок после дупликации: хромосомная мозаика
- 13. Геномы и виды Хромосомная нестабильность У человека
- 14. Виды и далее Нематоды, дрозофилы и млекопитающие (не)Монофилетические таксоны. Птицы как класс рептилий.
- 15. О происхождении жизни Археи и бактерии: Независимое
Слайд 2Статус гена в геноме
PPI – количесто белок-белковых взаимодействий
EL – уровень экспрессии
KE
– летальность нокаутов
ER – скорость эволюции
PGL – вероятность потери в геноме
NP – количество паралогов
GI – количество геномных взимодействий
ER – скорость эволюции
PGL – вероятность потери в геноме
NP – количество паралогов
GI – количество геномных взимодействий
Слайд 3Гены и геномы - деревья
Дерево генов может не совпадать с деревом
видов
Дупликации
Делеции
Горизонтальные переносы
Дупликации
Делеции
Горизонтальные переносы
Слайд 4Задача согласования деревьев
«вложение» дерева видов в дерево генов с минимальным числом
дупликаций и делеций
(минимальное) количество дупликаций и делеций связано (чем раньше дупликации и чем их больше, тем больше делеций), так что можно минимизировать одновременно
… и горизонтальных переносов
Проблема: как взвешивать события?
Всегда можно обойтись минимальным числом дупликаций и очень многими делециями без переносов
И наоборот – одними переносами
(минимальное) количество дупликаций и делеций связано (чем раньше дупликации и чем их больше, тем больше делеций), так что можно минимизировать одновременно
… и горизонтальных переносов
Проблема: как взвешивать события?
Всегда можно обойтись минимальным числом дупликаций и очень многими делециями без переносов
И наоборот – одними переносами
Слайд 5Альтернативные подходы к идентификации горизонтальных переносов
Не тот ближайший родственник (митохондрии, термотога,
аквифекс)
Гены, которые слишком близко друг к другу (много ближе, чем полагается для данной пары геномов)
Ср. контроль ортологичности
Упражнение: как будут выглядеть дерево и график, если геном Х известен и есть еще более далекий Z?
Гены, которые слишком близко друг к другу (много ближе, чем полагается для данной пары геномов)
Ср. контроль ортологичности
Упражнение: как будут выглядеть дерево и график, если геном Х известен и есть еще более далекий Z?
Слайд 13Геномы и виды
Хромосомная нестабильность
У человека и шимпанзе разное число хромосом
Слепушонки
Симбиогенез
Митохондрии и
хлоропласты. Нуклеоморф
Buchnera и т.п.
Вольбахия; осы
Цихлиды и трехиглые колюшки
Buchnera и т.п.
Вольбахия; осы
Цихлиды и трехиглые колюшки
Слайд 14Виды и далее
Нематоды, дрозофилы и млекопитающие
(не)Монофилетические таксоны. Птицы как класс рептилий.
Слайд 15О происхождении жизни
Археи и бактерии:
Независимое происхождение мембран (разные вещества, негомологичные пути
синтеза)
Существенно разная репликация ДНК
Похожие компоненты трансляции и транскрипции
Как общие, так и специфические метаболические пути
Существенно разная репликация ДНК
Похожие компоненты трансляции и транскрипции
Как общие, так и специфические метаболические пути
