Тарасова, М.В. Куртуков, В.И. Людыно, А.Н. Суворов, ООО «НИЛ Диагностика», НИИЭМ СЗО РАМН, Военно-медицинская академия, Санкт-Петербург
- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Анализ микробиоты кишечника и экспресс-диагностика острых кишечных инфекций методом ПЦР презентация
Содержание
- 1. Анализ микробиоты кишечника и экспресс-диагностика острых кишечных инфекций методом ПЦР
- 2. Из каких микробов состоит кишечная флора?
- 3. Наименование микроорганизмов Состав кишечной микрофлоры по ОСТ 91500.11.0004-2003
- 4. Состав кишечной микрофлоры по ОСТ 91500.11.0004-2003
- 5. Наиболее распространенные обитатели кишечника (Zoetendal E., 2006)
- 6. Состав микрофлоры взрослого человека (Европа) Состав микрофлоры взрослого человека по ОСТ91500.11.0004-2003
- 7. Бактериологический посев Микроскопия Дыхательный тест Генно- молекулярные
- 8. Анализируемые показатели
- 9. Преимущества и недостатки метода ПЦР в реальном
- 10. Анализ микробиоценоза кишечника методом ПЦР в реальном
- 11. Основные варианты дисбиотических нарушений, выявляемые методом ПЦР
- 12. Выявление в диагностически значимых количествах (>10*4) представителей
- 13. Экспресс дифференциальная диагностика ОКИ Перечень возбудителей (всего
Из каких микробов состоит кишечная флора? Как определить ее состав? Зачем это делать? Три вопроса клинициста к микробиологу
Слайд 1Анализ микробиоты кишечника и экспресс-диагностика острых кишечных инфекций методом ПЦР
Суворова, Е.А.
Слайд 2
Из каких микробов состоит кишечная флора?
Как определить ее состав?
Зачем это делать?
Три вопроса клинициста к микробиологу
Слайд 6Состав микрофлоры взрослого человека (Европа)
Состав микрофлоры взрослого человека по ОСТ91500.11.0004-2003
Слайд 7Бактериологический посев
Микроскопия
Дыхательный тест
Генно- молекулярные методы
PCR/denaturing electrophoretic polyacrylamide gels (PCR/DGGE, PCR/TTGE)
Fluorescent in
situ hybridization/fluorescence-activated cell sorting (FISH/FC)
16S rRNA филогения
Метагеномика
Мета транскриптомика
ПЦР в режиме реального времени
16S rRNA филогения
Метагеномика
Мета транскриптомика
ПЦР в режиме реального времени
Методы определения микрофлоры кишечника
Слайд 9Преимущества и недостатки метода ПЦР в реальном времени:
+ эффективность в обнаружении
анаэробных бактерий
+ быстрота выполнения (1-2 суток)
+ доступные условия транспортировки анализируемого материала до лаборатории (до двух дней в холодильнике)
- невозможность подбора противомикробных препаратов
+ быстрота выполнения (1-2 суток)
+ доступные условия транспортировки анализируемого материала до лаборатории (до двух дней в холодильнике)
- невозможность подбора противомикробных препаратов
Слайд 10Анализ микробиоценоза кишечника методом ПЦР в реальном времени
- Bacteroides fragilis
Этапы
исследования:
Выделение бактериальной ДНК
Амплификация специфических участков бактериального генома и детекция флуоресцентного сигнала в реальном времени
Расчет количественного соотношения бактерий по величине порогового цикла (абсолютное количество и отношение к общему бактериальному числу)
Выделение бактериальной ДНК
Амплификация специфических участков бактериального генома и детекция флуоресцентного сигнала в реальном времени
Расчет количественного соотношения бактерий по величине порогового цикла (абсолютное количество и отношение к общему бактериальному числу)
Слайд 11Основные варианты дисбиотических нарушений, выявляемые методом ПЦР в реальном времени
1.
значительное увеличение числа Bacteroides fragilis и соответственно изменение количественного соотношения Bacteroides fragilis/ Fecalibacterium prauznitzii.
Норма
Патология
(язвенный колит)
- Bacteroides fragilis (Сt=23)
- Fecalibacterium prauznitzii (Сt=25)
- Bacteroides fragilis (Сt=16)
- Fecalibacterium prauznitzii (Сt=28)
Слайд 12Выявление в диагностически значимых количествах (>10*4) представителей условно-патогенной флоры (Clostridium difficile,
Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonia), в особенности штаммов, несущих гены патогенности
Изменение соотношения субпопуляций анаэробных бактерий, осуществляющих различные виды брожения (например, продуцентов бутирата и продуцентов пропионата)
Изменение соотношения субпопуляций анаэробных бактерий, осуществляющих различные виды брожения (например, продуцентов бутирата и продуцентов пропионата)
Слайд 13Экспресс дифференциальная диагностика ОКИ
Перечень возбудителей (всего 14) :
-ротавирусы (типов А, В
и С)
-норовирусы (1 и 2 типа)
-аденовирус (тип F)
-астровирус
-вирус гепатита А -парвовирус B19
-энтеровирусы
-Shigella spp. -Salmonella spp.
-Campylobacter spp. -энтероинвазивные Escherichia coli
-Clostridium difificile (токсин А и токсин В) -Yersinia pseudotuberculosis -Yersinia enterocolitica
-вирус гепатита А -парвовирус B19
-энтеровирусы
-Shigella spp. -Salmonella spp.
-Campylobacter spp. -энтероинвазивные Escherichia coli
-Clostridium difificile (токсин А и токсин В) -Yersinia pseudotuberculosis -Yersinia enterocolitica
