Загальна характеристика родини Coronaviridae презентация

інфекцій, спричинених коронавірусами
SARS як чинник атипової пневмонії

Рід Arterivirus

3. Родина Roniviridae
3.1. Рід Okavirus

першого типу, коронавіруси собак першого й другого типів, котів першого й другого (вірус інфекційного перитоніту котів) типів, інфекційного гастроентериту свиней, вірус інфекційного трахеобронхіту свиней ISU-1, людські коронавіруси 229 Е та NL 63, коронавіруси кажанів Scotophilus 512 тощо.

(NC99), мишей (вірус гепатиту мишей), гемаглютинуючий вірус енцефаломієліту свиней, SARS-подібні віруси, коронавірус пацюків, коронавіруси кажанів Pipistrellus HKU5, Rousettus HKU9 тощо.
3. Рід Gammacoronavirus – коронавіруси птахів (вірус інфекційного бронхіту курей, коронавірус індиків) і кита-білухи.

вірус Берне, вірус Бреда (ВРХ), торовіруси людини та свиней.
2.         Рід Bifinivirus – вірус білого ляща.

(діаметр 64 нм), оточує спіральний нуклеокапсид.
Пепломери (тримери (зубець шип)-spike protein) довжиною біля 20 нм. У деяких коронавірусів другий шар пепломерів формує гемаглютинінестеразу (НЕ).

індукція нейтралізуючих антитіл. Головний антиген. Найбільший – з 1452 АК. У деяких коронавірусів розпадається на S1 і S2 субодиниці;
M (membrane protein) –- брунькування та формування оболонки віріону. З 225-260 АК. Може індукувати а-інтерферон;
E (small membrane protein) – асоційований з оболонкою білок. З 80-109 АК. Разом з М білком приймає участь у збірці віріонів;
НЕ - гемаглютинінестераза (присутній не у всіх вірусів). Частково споріднений з НЕ вірусу грипу С.

N (білок нуклеокапсиду) – асоційований з геномом, основний фосфопротеїн. Приймає участь у реплікації геному.

1b, які перекриваються в декількох нтд. Ген pol може відповідати за функції 3С-подібної протеази, багатий на цистеїн фактор росту, РНК-зал-РНК-пол, нуклекапсид трифосфат (НТФ) приєднувальний/хеліказний домен та домен приєднання до НК.

kb.
На 5’- кінці - сар, а на 3’- кінці - poly (A).
На 5’- кінці за сар структурою знаходиться лідуюча послідовність з 65-98 нтд та регіон з 200-400 нтд, що не транслюється (UTR).
На 3’- кінці poly (A) передує UTR, що складається з 200-500 нтд.

(Rep)-- Spike (S)-- Envelope (E)-- Membrane (M)-- Nucleocapsid (N) –3’

Rota. P. et. al

сахарози 1,15-1,2 г/см3, а у CsCl – 1,23-1,24 г/см3. Константа седиментації –300-500 S.
Віріони чутливі до підвищенної температури, органічних розчинників, неіонних детергентів, формальдегіду, окисників (кілька хв) та ультра-фіолетового опромінення (10-15хв). Пряме сонячне опромінення призводить до повільної інактивації вірусів – 3 год при 37-38ºС.
Деякі представиники двох родів стійкі при рН 3. Оптимальний рН – 7-7,5. Віріони зберігають інфекційність у ліофілізованому стані при 4С впродовж років, у замороженому – при температурі –70ºС. Коронавіруси зберігають інфекційну активність у повітрі у вигляді аерозолю протягом 8-10 год, у питній воді – до 9 діб, при температурі 0-18ºС поза приміщенням – до 4-10 діб, нижче за 0ºС – до 33-44 діб.

полімерази, яка потім продукує повнорозмірну – РНК, яка використовується як матриця для утворення транскриптів мРНК з ідентичними 5’-кінцями (неструктурна лідуюча послідовність з 72 нтд) та відповідним генам 3’ кінця. Кожна мРНК – моноцистронна, гени з 5’-кінця транскрибуються з утворенням найдовшої мРНК і т.д. Ці мРНК утворюються не в результаті сплайсингу, а за рахунок специфічної роботи полімерази. Між кожним з генів існує повторювальна послідовність – UCUAAAC – що взаємодіє з полімеразою та клітинними факторами для зшивки лідуючої послідовності з початком кожної ORF.

викликають:
-        Респіраторні інфекції, включаючи SARS;
-   Ураження ШКТ (в основному у немовлят, менше 1 року);
-         Неврологічний синдром (рідко).

головним болем, гіпоксією (низька концентрація кисню у крові), лімфопенією та низьким рівнем АлАт (що вказує на руйнування печінки). Смерть може наступити в результаті прогресуючої респіраторної недостатності через руйнування альвеол.

Ураження ШКТ є менш типовим. Воно характеризується наявністю діареї (27%), блювоти (14%), черевним болем (13%).

Інкубаційний період SARS – 4-6 діб.

Відсоток смертності:
для пацієнтів молодших 60 років - 2-13%
для старших 60 років - 3-43%.

симптомів триває від 2 до 16 днів
інтесивна терапія потрібна не пізніше ніж через 10 днів після появи симптомів
Виділяють 3 фази захворювання:
1 тиждень: симптоми ГРВІ,гарячка, міалгія, озноб та біль у горлі.
2 тиждень, повторна гарячка. Початок діареї та кисневої недостатності.
3 тижден. Лише 20% досягає цієї фазиі потребують штучної вентиляції легень.
Відсоток смертності становить 10%.

Бер. 2003

Канада
14 Бер. 2003

15 Бер. 2003
Підвищений рівень глобальної небезпеки

10 Лют. 2003

Гуандонг

З 15 березня до 7 квітня у 18 країнах виявлено SARS: ВООЗ оголосила глобальну небезпеку

27 Бер. 2003
ВООЗ рекомендує ввести нові вимоги
до міжнародних подорожей

2 Квіт. 2003
Експерти ВООЗ добровільне утримання від не важливих подорожей до Гонконгу та провінції Гуандонг в Китаї

Сінгапур
Бер. 2003

1402
Італія 3
Ірландія 1
Іспанія 1
Канада 132

Китай* 1959
Малайзія 6
Німеччина 5 Румунія 1
Сінгапур 178
США 39
Тайвань (Китай) 21
Таїланд 7
Франція 3
Швейцарія 1

Всього = 2 461 випадків та 98 загиблих

In bold, affected areas/countries in which local chain(s) of transmission of SARS is/are occurring as reported by the national public health authorities

SARS
Не поширене захворювання серед диких та свійських тварин (цивет)
У цивет не формується імунітету до SARS-CoV

диких кажанів (подковоноси) у Китаї.
Індикація:
Віруси з гомогологією у 92% до віруса SARS виділені дослідниками з Академії Наук Китая з трьох видів кажанів.
У цих тварин перебіг інфекції був або малосимптомний або безсимптомний

Безпосередня передача від кажана до людини навряд відбувається
Між вірусами існує різниця в генах, що кодують білки-прикріплення.
Можливо відбулася пердача вірусу до проміжного хазяїна (цивета) та його адаптація в такий спосіб, що призвів до інфікування людини.
Вважають, що підковоноси є природним резервуаром SARS!

galleries.news24.com/. ../images/11.jpg

zmmu.msu.ru/bats/rusbats/ pictures/rhboch.jpg

preventive measures against SARS

Не показано ефективність антивірусних препаратів при лікуванні SARS чи інших крорнавірусів. Хіміотерапевничні препарати та вакцина знаходиться у стадії розробки.
Неспецифічна профілактика!