- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Віруси з + РНК геномом презентация
Содержание
- 1. Віруси з + РНК геномом
- 2. Реплікація/транскрипція + РНК-вмісних вірусів
- 3. Одноланцюгові РНК-геноми AUG GCA CGA UAC CGU
- 4. Генетичні карти РНК-вмісних вірусів
- 5. Вторинна структура РНК U U
- 6. Stem – “стовбур” Loop – “петля” Pseudoknot – “псевдовузол”
- 7. Вторинна структура РНК Hairpin loop Junction (Multiloop)
- 8. Структура РНК Рибосомальна РНК Варіанти третинної структури
- 9. Рибозимна активність (The hammerhead ribozyme (plant
- 13. Virus (+)strand RNA Genome (+) 5’ Реплікаційна стратегія (+)-ланцюгових РНК вірусів
- 14. Virus (+)strand RNA Genome Viral proteins
- 15. Геном ВТМ (6,3-6,6 тнп)
- 16. Експресія геному ВТМ
- 18. Експресія геному вірусу поліомієліту
- 19. Структура геному поліовірусу
- 20. Структура геному поліовірусу •Геном поліовірусу включає
- 21. Протеолітичний процессінг
- 22. - Трансляція пікорнавірусів є cap незалежною
- 25. Першим кроком реплікації є трансляція вірусної
- 26. РНК поліовірусу зв'язана з 22АК VPg
- 27. Високоспарена структура, сформована 108 нуклеотидами на 5’
- 28. Синтез -РНК Прекурсор VPg,
- 29. Протеаза 3CDpro розрізає мембранний зв'язок 3AB
- 30. Вірусний білок 2C зв'язується
- 31. Субгеномні РНК Coronaviridae (6 класів) Ідентичні як
- 32. Borrowed from web file, Mark R. Denison, M.D., Vanderbilt
- 34. 7 5' Genome RNA 3' 2
- 35. 7 5' 3' Genome RNA 3'
- 36. 7 5' 3' Genome RNA 3'
- 37. 7 5' 3' Genome RNA 3'
- 38. 7 5' 3' Genome RNA 3'
- 39. 7 5' 3' Genome RNA 3'
- 40. Транскрипція і реплікація Coronavirus 7
- 41. Вірус мозаїки бромусу (Brome
- 42. 1а протеїн (РНК1) - метилтрансфераза, геліказа
- 43. Експресія геному БМВ
- 44. Синтез субгеномної RNA вимагає взаємодії реплікази
- 45. ВТМ як вектор
- 46. ВТМ як вектор
Реплікація/транскрипція
+ РНК-вмісних вірусів
Слайд 3Одноланцюгові РНК-геноми
AUG GCA CGA
UAC CGU GCU
met ala arg
+ (смислові) або
-
(антисмислові) РНК-геноми
Слайд 5Вторинна структура РНК
U U
C G
U A
A U
G C
5’ 3’
5’
G A U C U U G A U C
3’
STEM
LOOP
Молекула РНК «закривається» сама на себе
Можливі віріанти з'єднання:
G C A U G U
hydrogen bond
Слайд 7Вторинна структура РНК
Hairpin loop
Junction (Multiloop)
Bulge Loop
Single-Stranded
Interior Loop
Stem
Image– Wuchty
Pseudoknot
Слайд 9Рибозимна активність
(The hammerhead ribozyme (plant virus)
- tertiary structure
Scott et al
and Klug, Science 1996
Слайд 14Virus (+)strand RNA Genome
Viral proteins
5’
(adapted from Sanfacon, 2006)
Вірусний реплікаційний комплекс (VRC)
Host protein(s)
vRdRp
Слайд 20Структура геному поліовірусу
•Геном поліовірусу включає одну ORF, яка кодує 247 kD
поліпротеїн. На 5’-кінці VPg, на 3’-кінці poly(A) тракт
•Процессінг йде в 3 етапи. Перший - розрізання P1 попередника капсидного білку, яке каталізує 2Apro
• Другий крок - процессінг некапсидних і капсидних попередників, що каталізується 3Cpro і 3CDpro
• Третій крок - перехід VP0 в VP4 і VP2
•Процессінг йде в 3 етапи. Перший - розрізання P1 попередника капсидного білку, яке каталізує 2Apro
• Другий крок - процессінг некапсидних і капсидних попередників, що каталізується 3Cpro і 3CDpro
• Третій крок - перехід VP0 в VP4 і VP2
Слайд 22- Трансляція пікорнавірусів є cap незалежною
- мРНК пікорнавірусів не має
cap (pUp) на її 5’ кінці
- Геном має довгу (743 nt) UTR нетрансльовану лідерну послідовність, що передує сайту ініціації трансляції.
- Зв'язування з рибосомою відбувається завдяки Internal Ribosomal Entry Sequence (IRES).
- IRES містить високий рівень вторинних структур в лідерній UTR послідовності, яка є посередником зв'язування з 40 S рибосомою.
- eIF-3, eIF-4G і eIF-4a допомагать збірці IRES.Також потрібний клітинний фактор Х.
- Геном має довгу (743 nt) UTR нетрансльовану лідерну послідовність, що передує сайту ініціації трансляції.
- Зв'язування з рибосомою відбувається завдяки Internal Ribosomal Entry Sequence (IRES).
- IRES містить високий рівень вторинних структур в лідерній UTR послідовності, яка є посередником зв'язування з 40 S рибосомою.
- eIF-3, eIF-4G і eIF-4a допомагать збірці IRES.Також потрібний клітинний фактор Х.
Трансляція
Слайд 25 Першим кроком реплікації є трансляція вірусної РНК
Використовується РНК-РНК копіювальний механізм
Реплікативна РНК має VPg, але mRNAs його не мають
Реплікація
Слайд 26 РНК поліовірусу зв'язана з 22АК VPg через уридин-тирозиновий фосфодиефірний зв'язок
Протягом реплікації відбувається розщеплення фосфодиефірного зв'язку клітинним ферментом для виробництва віруснийх мРНК, що містять 5’термінальний Up
Геномні РНК інкорпоруються в віріони з VPg на 5’-кінці.
Ці етапи відбуваються в везикулах, що утворюються з гладкого ЕР
Геномні РНК інкорпоруються в віріони з VPg на 5’-кінці.
Ці етапи відбуваються в везикулах, що утворюються з гладкого ЕР
Реплікація
Слайд 27Високоспарена структура, сформована 108 нуклеотидами на 5’ кінці (+) ланцюга РНК,
утворює "листок конюшини"
Вірусний протеїн 3CD і PCBP клітинний протеїн (PolyrC Binding Protein), взаємодіє з різними петлями cloverleaf. Ця взаємодія закінчується зближенням 5’і 3’ кінця. У цей момент VPg починає функцінувати як праймер
Після синтезу мінус-РНК подібний "лист конюшини" формується в 5’ кінці негативного ланцюга. Утворення цього рибонуклеопротеїнового комплексу потрібне для синтезу як плюс, так і мінус ланцюга РНК.
Реплікація
Слайд 28Синтез -РНК
Прекурсор VPg, 3AB, служить донором VPg
Рибонуклеопротеїновий комплекс сформований, коли PCbp і 3CDpro зв’язується з cloverleaf структурою
Цей комплекс взаємодіє з PAbp1, продукуючи циркулярний геном
Цей комплекс взаємодіє з PAbp1, продукуючи циркулярний геном
Слайд 29 Протеаза 3CDpro розрізає мембранний зв'язок 3AB для продукції VPg
VPg,
уридинильований 3Dpol, використовує cre послідовність як матрицю і переміщається в 3’ кінець генома
3D pol використовує uridylated VPg як праймер для синтезу (–) РНК
3D pol використовує uridylated VPg як праймер для синтезу (–) РНК
Синтез -РНК
Слайд 30
Вірусний білок 2C зв'язується з “cloverleaf” в (-) ланцюгу
Мембранний зв'язок з 3AB розривається для продукції VPg
VPg уридинилюється 3Dpol, використовуючи 3’ термінальні залишки А (–) ланцюга як матрицю
Уридинильований VPg потім елонгується 3Dpol для синтезу (+)RNA
VPg уридинилюється 3Dpol, використовуючи 3’ термінальні залишки А (–) ланцюга як матрицю
Уридинильований VPg потім елонгується 3Dpol для синтезу (+)RNA
Синтез +РНК
Слайд 31Субгеномні РНК
Coronaviridae
(6 класів)
Ідентичні як на 3”,
так і на 5’-кінцях
“лідер” –
70нп
“-” РНК на ранніх стадіях
інфекційного циклу,
“+” РНК на пізніх
Слайд 34
7
5'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
An
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
Borrowed from web file, Mark
R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 35
7
5'
3'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
Intermediate
RNA
An
5'
Un
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
5'
3'
An
Genome
RNA
Borrowed from web file, Mark
R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 36
7
5'
3'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
An
An
5'
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
Borrowed from web file, Mark
R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 37
7
5'
3'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
An
An
5'
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
Borrowed from web file, Mark
R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 38
7
5'
3'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
An
Un
5'
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
Borrowed from web file, Mark
R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 39
7
5'
3'
Genome
RNA
3'
2
3
4
5
6
An
Un
5'
Транскрипція і реплікація Coronavirus
Replicase gene
genes 2-7
An
(-) strand
subgenomic RNA
(+) strand
Subgenomic mRNA
Spike (S)
Borrowed from web file, Mark R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 40Транскрипція і реплікація Coronavirus
7
RNA
5'
3'
Genomic
RNA
Leader
RNA
3'
Spike (S)
M
N
E
NS
NS
Gene 1
Replicase
Proteins
1
2
3
4
5
6
Genes 2-7
RNA
3
4
5
6
7
2
5'
3'
An
An
5'
Un
Subgenomic
RNAs
(
+/-
)
Genomic
RNA
Replicase
Borrowed from web file,
Mark R. Denison, M.D., Vanderbilt
Слайд 41Вірус мозаїки бромусу
(Brome mosaic virus, BMV)
(Rao, 2006)
Протеїни
реплікази BMV забезпечують специфічність упаковки
Слайд 42
1а протеїн (РНК1) - метилтрансфераза, геліказа (110 кДа)
2а протеїн (РНК2)
– РНКзРНКп (91 кДа)
3а протеїн (РНК3) – білок руху (МР) (30 кДа)
СР (РНК3) – структурний білок (21 кДа)
3а протеїн (РНК3) – білок руху (МР) (30 кДа)
СР (РНК3) – структурний білок (21 кДа)
Слайд 44
Синтез субгеномної RNA вимагає взаємодії реплікази з послідовністю промотора в мінус-ланцюзі
RNA3, який безпосередньо розташований «вгору за течією» від RNA4 ініціаторної послідовності
