Молекулярная биофизика. Биологические макромолекулы в растворе, теория Дебая - Хюккеля презентация

Содержание

Как синтезированная белковая цепь, изначально «одномерная», принимает уникальную, только ей свойственную, пространственную укладку, обеспечивающую выполнение назначенной этому белку функции? ?

Слайд 1Молекулярная биофизика. Биологические макромолекулы в растворе, теория Дебая - Хюккеля


Слайд 2Как синтезированная белковая цепь, изначально «одномерная», принимает уникальную, только ей свойственную, пространственную

укладку, обеспечивающую выполнение назначенной этому белку функции?

?


Слайд 3Каким образом молекулы липидов, будучи смешаны с водой, образуют пузырьки и

другие структуры, очень напоминающие мембраны живых клеток?

?


Слайд 4 Основная «догма» молекулярной биофизики: структура, функция и динамика биологических макромолекул

неразрывно связаны между собой

Слайд 5Одним из первых биофизических экспериментов может считаться знаменитый опыт Гальвани — во времена, когда

не только о компьютерах никто не слыхивал, но и до открытия молекул, как таковых, оставалось ещё минимум столетие

Luigi Galvani
1737—1798


Слайд 6Одним из первых молекулярных биофизиков может считаться
Эрвин Шрёдингер, чья книга «Что

такое жизнь с точки зрения физики?», написанная в 1944 году, и по сей день не утратила своей актуальности

(12.08.1887 - 4.01.1961)


Слайд 7Представление молекулы с точки зрения молекулярной механики
Параметры молекулы описываются не уравнением Шрёдингера,

а суммой «классических» взаимодействий, самое сложное из которых — формула для упругости, описывающая колебание пружинки. На рисунке схематично показаны лишь три таких слагаемых: валентная связь (R0), валентный угол (α0) и торсионный угол (φ0).

Слайд 17Масс-спектроскопия
(масс-спектроскопия, масс-спектрография, масс-спектральный анализ, масс-спектрометрический анализ) — метод исследования вещества,

основанный на определении отношения массы к заряду ионов, образующихся при ионизации представляющих интерес компонентов пробы

Слайд 22СПЕЦИФИКА БИОМАКРОМОЛЕКУЛ
СТАТИСТИЧЕСКИЙ ХАРАКТЕР ПОВЕДЕНИЯ, Т.К. БИОМАКРОМОЛЕКУЛЫ СОСТОЯТ ИЗ БОЛЬШОГО ЧИСЛА ОДНОТИПНЫХ

ЗВЕНЬЕВ – МОНОМЕРОВ.

НАЛИЧИЕ НЕ ТОЛЬКО ХИМИЧЕСКИХ СВЯЗЕЙ, НО И ДРУГИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ РАЗНОГО ТИПА, ЧТО ОГРАНИЧИВАЕТ ЧИСЛО ВОЗМОЖНЫХ КОНФОРМАЦИЙ.

Слайд 23Теория Дебая-Хюккеля
Теория сильных электролитов (1923 г.)

Основные положения:
Сильные электролиты в водных растворах

практически полностью ионизированы. Ионы – материальные точки с зарядами;
При высокой концентрации ионов и малыми расстояниями между ними ионы взаимодействуют между собой (кулоновские взаимодействия);
Межионное взаимодействие приводит к тому, что каждый из ионов становится кружен «роем» противоионов, так называемой ионной атмосферой;
Межионное взаимодействие приводит к снижению подвижности ионов и уменьшает степень их участия в процессах, происходящих в растворах.





Слайд 24БММ (белки, НК) содержат большое число ионизированных групп, в результате чего

на поверхности ММ имеется заряд. Энергия взаимодействия между заряженными ММ будет зависеть, в том числе, и от наличия ионов в ОС.

Задача: на расстоянии Х определим потенциал ϕ, который создает заряженная сферическая макромолекула (М) в водном растворе с определенной концентрацией соли



Слайд 25Используем для решения уравнение Пуассона, которое связывает плотность заряда (ρ) в

точке поля с его потенциалом (ϕ):

Также необходимо учесть, что на ориентацию ионов вблизи ММ будут влиять тепловые колебания, в результате чего количество ионов будет подчиняться распределению Больцмана:

(2)

(1)

Обозначим заряд иона i – типа ei и количество ионов в единице объема n’i

Электрическая энергия иона

Тепловая
энергия иона

Подставив в уравнение Пуассона (1) уравнения (2) и (3), получим

(3)


Слайд 26Подставив в уравнение Пуассона (1) уравнения (2) и (3), получим
Решение этого

уравнения имеет вид

Таким образом, потенциал ММ уменьшается с расстоянием по экспоненциальному закону

Решение этого уравнения, учитывающее размер ММ радиусом r, имеет вид


Слайд 27Зависимость электрического потенциала ϕ , создаваемого макромолекулой,
от расстояния Х


Слайд 28Расстояние Х0, на котором ϕ падает в е раз (ϕ =

0,37ϕ0), называется дебаевской длиной.
Это толщина ионной оболочки которая окружает в электролите каждую заряженную молекулу.

Слайд 29Влияние концентрации ионов на взаимодействие заряженных ММ определяется ионной силой раствора

(μ):

Тогда толщина ионной оболочки Х0:

Т.е., при большой ионной силе раствора (высокой концентрации соли) оболочка ионов становится меньше (тоньше) и все ионы прижимаются к поверхности ММ


Слайд 31В разбавленных солевых растворах, когда ионная сила небольшая, а дебаевская длина

большая, то между ММ возникают силы отталкивания за счет больших оболочек противоионов. Но при повышении концентрации соли (увеличении ионной силы) дебаевская длина уменьшается и преобладают силы притяжения.

При высокой ионной силе белок осаждается в растворе и это явление называется высаливанием. Оно используется для экстрагирования и очистки белков.


Слайд 32Дополнение:

При взаимодействии заряженных ММ с дипольными молекулами воды происходит образование гидратных

оболочек.
Чем меньше радиус иона, тем больше его энергия и тем больше молекул воды к нему присоединится. Поэтому самые маленькие ионы при гидратации превращаются в большие гидратированные.

В периодах радиусы уменьшаются (Li → Be → B…) = большая оболочка
В подгруппах радиусы увеличиваются (Li → Na → … → Cs) = малая оболочка



Слайд 33Лекция №2

«Конформация макромолекул. Виды конформационных перестроек»

16 февраля 2017 г. ауд.

205
13.50


Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика