Методологический редукционизм в генетике презентация

могут быть полностью объяснены с помощью законов, свойственных явлениям более простым

подходе
Логические ошибки в интерпретации результатов биологического эксперимента

вспоминаешь ответ Гамлета на вопрос, что он читает,- слова, слова, слова»

of natural selection…»
Пангенез: «геммулы»

Наш выживший герой, возможно, станет среди них королём; он убьёт очень много чёрнокожих людей в борьбе за выживание; он заведёт очень много жён и детей, в то время как множество его подданных будут жить холостяками и умрут холостяками… Качества и способности нашего белого человека несомненно помогут ему дожить до глубокой старости, но даже его длинной жизни явно не хватит для того, чтобы кто-то из его потомков в каком-либо поколении стал полностью белыми… В первом поколении будет несколько дюжин смышлёных молодых мулатов, чей ум будет в среднем превосходить негритянский. Нас не удивит, что трон в течение нескольких поколений будет принадлежать более или менее желтокожему королю; но сможет ли поверить кто-то, что население всего острова постепенно станет белым, или пусть даже жёлтым?..»

закончив чтение статьи»

наследственной информации

самые законы природы, что и в настоящее время.

«Бритва Оккама»

изменчивости с такой правильностью, что, зная ряд форм в пределах одного вида, можно предвидеть нахождение параллельных форм у других видов и родов.

отождествляется с хронологической.

воспринимаются как реалии, физические объекты.
«The map is not the territory»

сколько-нибудь однозначной информации о развитии»

Л.В. Белоусов (2009) Информационный вестник ВОГиС 13: 29

биологической (а также медицинской и психологической) статистики

Дактилоскопия

Метеорология

Регрессионный анализ

Коэффициент корреляции Пирсона

синтетической теории эволюции, «отец биологической статистики».

Дискриминантный анализ

Дисперсионный анализ (ANOVA)

Точный критерий Фишера

между двумя гипотезами: нулевой (H0) и альтернативной (H1)

строгое утверждение (коэффициент корреляции = 0,5),

Альтернативная — просто ее отрицание, поэтому составлена из несчетного множества «элементарных» утверждений

(коэфф. корреляции =0,63; коэфф. корреляции =0,4999(5);
коэфф. корреляции = —1/π)

Чаще всего альтернативной гипотезой является наличие некоего эффекта (явления), вызывающего систематическое отклонение в результатах.

II рода (false-Negative) — необнаружение существующего эффекта

Р-значение показывает вероятность ошибки I рода при условии, что верна нулевая гипотеза.

«Ты совершаешь ошибку первого рода, если придаешь значение пустякам»

[the value for which P=0.05, or 1 in 20] as a limit in judging whether a deviation ought to be considered significant or not… Using this criterion we should be led to follow up a false indication only once in 20 trials, even if the statistics were the only guide available. Small effects will still escape notice if the data are insufficiently numerous to bring them out, but no lowering of the standard of significance would meet this difficulty.

... it is convenient to draw the line at about the level at which we can say: "Either there is something in the treatment, or a coincidence has occurred such as does not occur more than once in twenty trials."...

If P is between .1 and .9 there is certainly no reason to suspect the hypothesis tested. If it is below .02 it is strongly indicated that the hypothesis fails to account for the whole of the facts. Belief in the hypothesis as an accurate representation of the population sampled is confronted by the logical disjunction: Either the hypothesis is untrue, or the value of 2 has attained by chance an exceptionally high value. The actual value of P obtainable from the table by interpolation indicates the strength of the evidence against the hypothesis. A value of 2 exceeding the 5 per cent. point is seldom to be disregarded.

Also sprach R.A. Fisher:

вероятностей, соответствующие значениям критериев.

Старейший журнал по биостатистике, изданный Карлом Пирсоном.

Карл Пирсон – протеже Гальтона, еще один «отец» биостатистики

где оно служит количественной, а не качественной мерой значимости. Это близко к подходу, предлагаемому (иногда) Фишером.

сравнений

Если не иметь предварительных идей о направлении поиска, и искать «хоть что-то», то вы что-то (статистическую значимость) найдете. Но будет ли это реальный эффект, а не случайная флуктуация?

QUI QUERIT, REPERIT.

лишь ассоциацию.

X

Y

X

Y

X

Y

Z

GWAS (genome-wide association studies) выявляют не генные варианты, вызывающие болезни, а лишь маркеры таковых.