Презентация на тему Генетика бактерий

Презентация на тему Генетика бактерий, предмет презентации: Биология. Этот материал содержит 56 слайдов. Красочные слайды и илюстрации помогут Вам заинтересовать свою аудиторию. Для просмотра воспользуйтесь проигрывателем, если материал оказался полезным для Вас - поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте наш сайт презентаций ThePresentation.ru в закладки!

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1
Текст слайда:

Генетика бактерий

Профессор М.Н.Бойченко


Слайд 2
Текст слайда:

ПЛАЗМИДЫ

Размеры плазмид от 1 до 200 kilobase (kbp).
Количество плазмид в одной клетке от 1 до 1000 в зависимости от групп совместимости


Слайд 3
Текст слайда:

Типы плазмид

Трансмиссивные
Нетрансмиссивные

Интегративные
Неинтегративные
Совместимые
Несовместимые



Слайд 4
Текст слайда:

Типы плазмид

Трасмиссивные плазмиды обладают tra-опероном, который обеспечивает процесс конъюгации, т.е. передачу плазмиды из одной клетки в другую


Слайд 5
Текст слайда:

Типы плазмид

.
Fertility-F-плазмида содержит tra-оперон. Обеспечивает процесс конъюгации

Resistance-(R) фактор,содержит гены, обеспечивающие резистентность к антибиотикам.


Слайд 6
Текст слайда:

Типы плазмид

Col-плазмида, кодирующие синтез бактерицинов, которые убивают другие бактерии.
Плазмиды вирулентности – кодируют факторы агрессии у патогенных микробов


Слайд 7
Текст слайда:

Определение плазмидного профиля бактерий.

Плазмидный профиль позволяет произвести внутривидовую идентификацию бактерий. Для этого из бактериальной клетки выделяют плазмидную ДНК, которую разделяют электрофорезом в агарозном геле, для определения количества и размеров плазмид.


Слайд 8
Текст слайда:

Использование плазмид


Слайд 9
Текст слайда:

Подвижные генетические элементы обнаружены в составе бактериального генома, как в бактериальной хромосоме, так и в плазмидах. К подвижным генетическим элементам относятся вставочные последовательности и транспозоны.


Слайд 10
Текст слайда:

подвижные генетические элементы

Перемещение подвижных генетических элементов принято называть репликативной или незаконной рекомбинацией.
В отличие от бактериальной хромосомы и плазмид подвижные генетические элементы не являются самостоятельными репликонами, так как их репликация — составной элемент репликации ДНК репликона, в составе которого они находятся.



Слайд 11
Текст слайда:

IS-элементы

IS-элементы имеют размеры - 1000 н.п. и содержат лишь те гены, которые необходимы для их собственного перемещения — транспозиции: ген, кодирующий фермент транспозазу, обеспечивающую процесс исключения IS-элемента из ДНК и его интеграцию в новый локус, и ген, детерминирующий синтез репрессора, который регулирует весь процесс перемещения.


Слайд 12
Текст слайда:

IS-элементы

Эти гены по флангам окружены инвертированными повторами, которые служат сайтами рекомбинации, сопровождающей перемещения вставочной последовательности при участии транспозиционных ферментов, в частности транспозаз.



Слайд 13
Текст слайда:

IS-элементы

Инвертированные повторы узнает транспозаза, она делает одноцепочечные разрывы цепей ДНК, расположенных по обе стороны от IS элемента. Оригинальная копия IS-элемента остается на прежнем месте, а ее реплицированный дубликат перемещается на новый участок.



Слайд 14
Текст слайда:

Подвижные генетические элементы

Транспозоны — это сегменты ДНК, обладающие теми же свойствами, что и IS-элементы, но имеющие в своем составе структурные гены, например ген токсина, гены,обеспечивающие устойчивость к антибиотикам.


Слайд 15
Текст слайда:

Перемещение подвижных генетических элементов по репликону или между репликонами, вызывает:

1. Инактивацию генов тех участков ДНК, куда они, переместившись, встраиваются.
2. Образование повреждений генетического материала.
3. Слияние репликонов, т. е. встраивание плазмиды в хромосому.
4. Распространение генов в популяции бактерий, что может приводить к изменению биологических свойств популяции, смене возбудителей инфекционных заболеваний, а
также способствует эволюционным процессам среди микробов.


Слайд 16
Текст слайда:

Защита бактерий от антибиотиков осуществляется при помощи:
Плазмид
Транспозонов
Интегронов


Слайд 17
Текст слайда:


attC1

attI


attI




attC2

attC1

attI

attC1

attC2


5‘консервативный сегмент

кассета 1

кассета 2

Интегроны-система захвата и экспрессии генов которая состоит из гена intI , кодирующего интегразу, рекомбинационного сайта attI и промотера.





intI

P


Слайд 18
Текст слайда:

Интеграза через посредство сайт-специфической рекомбинации включает в интегрон или вырезает из него генные кассеты.
Мобильность генной кассеты составляет эффективную систему распространения генов резистентности к антибиотикам.


Слайд 19
Текст слайда:

Кассеты могут существовать в виде свободных циркулярных молекул ДНК, но обычно они интегрированы в линейной форме в интегрон
Генная кассета экспрессируется в интегроне с общего промотера, локализованного на 5’консервативном участке интегнора.


Слайд 20
Текст слайда:






G TTRRRY ген

RYYYAAC---------G TTRRRY

«Инвертированный Core сайт »

attC сайт

« Core сайт »

Кассеты состоят из одного гена и короткой последовательности, представляющей сайт специфической рекомбинации, который называется attC site, состоящий из 59 пар оснований « элемент 59-пар оснований »


Кассета



Слайд 21
Текст слайда:


Кассеты состоят из одного гена и короткой последовательности, представляющей сайт специфической рекомбинации, который называется attC site, состоящий из 59 пар оснований « элемент 59-пар оснований »






Слайд 22
Текст слайда:

Изменения генома

1. Мутации
2. Рекомбинации


Слайд 23

Слайд 24
Текст слайда:

Передача генетической информации


Слайд 25
Текст слайда:

Конъюгация


Слайд 26
Текст слайда:

F+ x F-


Слайд 27

Слайд 28
Текст слайда:

Общая трансдукция


Слайд 29

Слайд 30

Слайд 31
Текст слайда:

Схема трансфoрмации


Слайд 32
Текст слайда:

Молекулярные методы используемые в микробиологии

1. ПЦР
2. Микрочип

3.Риботипирование
4.Отпечатки пальцев
5.Плазмидный профиль
6. Мультилокусное секвенирование

Идентификация микроба без выделения чистой культуры

Внутривидовая идентификация


Слайд 33
Текст слайда:

Строение ДНК


Слайд 34
Текст слайда:

ПЦР


Слайд 35
Текст слайда:

амплификатор


Слайд 36
Текст слайда:

Риботипирование

Применяется для для выявления у изучаемых штаммов различий в количестве рибосомальных оперонов, а также рестрикционального полиморфизма их нуклеотидных последовательностей


Слайд 37
Текст слайда:

Риботипирование

1. Исследуемую ДНК подвергают рестрикции
2. Продукты рестрикции разделяют электрофорезом в полиакриламидном геле
3. Разделенные фрагменты наносят на мембрану и обрабатывают ДНК-зондами, кодирующими 16S и 23S
РНК


Слайд 38
Текст слайда:

Риботипирование

В результате гибридизации зонда с фрагментами ДНК, содержащими комплекс рРНК-оперонов (в бактериальной хромосоме имеются многочисленные опероны, содержащие гены 16Sи 23S РНК) образуется профиль, содержащий до 10 полос, обладающий видовой и штаммовой специфичностью, который исследуется автоматически.


Слайд 39
Текст слайда:

100-200 μm

ДНК микрочип:
Стеклянная пластика,
к которой прикреплены
молекулярные зонды






Слайд 40
Текст слайда:

Общая ДНК

Специфический ПЦР продукт
(i.e., 16S рРНК ген )

Меченая флюорохромом мишень
(ДНК или РНК)

Олигонуклеотидный зонд
Длиной от 15 до 30 nt

Гибридизация

Микрочип с зондами

Оценка результатов

Методика







Слайд 41
Текст слайда:







Много молекул мишений
Сильный сигналl

Слабый сигнал
Мало мишени

Нет сигнала
Нет мишени






Стеклянная пластинка

ДНК-зонд

Меченая искомая ДНК

Прикрепленный флюорохром

Фрагменты тотальной ДНК
(молекулы-мишени)

Принцип обнаружения специфической последовательности ДНК
при помощи микрочипа


Слайд 42
Текст слайда:

ПЦР в реальном времени

ПЦР в реальном времени позволяет провести полный анализ пробы в течение 20-60 мин и теоретически способен определить даже одну молекулу ДНК или РНК в пробе.


Слайд 43
Текст слайда:

ПЦР в реальном времени

. ПЦР в реальном времени использует зонд, несущий флуорофор и тушитель, комплементарный средней части амплифицируемого фрагмента. Когда флуорофор и тушитель связаны с олигонуклеотидным зондом, наблюдается лишь незначительная флуоресцентная эмиссия.


Слайд 44
Текст слайда:

ПЦР в реальном времени

Во время процесса амплификации за счет 5'-экзонуклеазной активности Taq-полимеразы флуоресцентная метка переходит в раствор, освобождаясь от соседства с тушителем, и генерирует флуоресцентный сигнал, усиливающийся в реальном времени пропорционально накоплению амплификата



Слайд 45
Текст слайда:

ПЦР в реальном времени


Слайд 46
Текст слайда:

Метод branched-DNA (bDNA) амплификации

В основе этого метода амплификация вирусной РНК осуществляется последовательными шагами олигонуклеотидной гибридизации.
Для этого используют серию первичных зондов и меченые ферментом вторичные зонды ДНК


Слайд 47
Текст слайда:

Метод branched-DNA (bDNA) амплификации

Первичные олигонуклеотидные зонды, специфичные для РНК (или ДНК) исследуемого образца, так называемых РНК- (ДНК) – мишений, фиксируются на твердой поверхности лунок микротитрационного планшета. Это, так называемые «зонды захвата». Исследуемый образец (РНК-мишень) разводится, и разведения добавляют в титрационные лунки.


Слайд 48
Текст слайда:

Метод branched-DNA (bDNA) амплификации

Внесенные молекулы РНК(ДНК) гибридизируются с «зондами захвата». После этого вносят меченые ферментом ДНК-зонды. Добавляют хемиолюминесцентный субстрат и измеряют интенсивность свечения, которая будет соответствовать количеству РНК-мишени в исследуемом образце.


Слайд 49
Текст слайда:

Метод branched-DNA (bDNA) амплификации

Количественное определение вирусной РНК проводят с использованием специальных референс-стандартов.



Слайд 50
Текст слайда:

Метод branched-DNA (bDNA) амплификации


Слайд 51
Текст слайда:

Мультилокусное секвенирование-типирование метод генетического типирования, основанный на определении последовательности нуклеотидов небольших фрагментов (500н.п.) ряда генов и последующем сравнении соответствующих последовательностей у разных организмов.


Слайд 52
Текст слайда:

Мультилокусное секвенирование-типирование

Чаще анализируют «гены домашнего хозяйства», которые являются необходимыми для протекания реакций основного метаболизма, а значит присутствуют у всех организмов. Они в силу своей исключительной важности, характеризуются низкой скоростью накопления мутаций


Слайд 53
Текст слайда:

Мультилокусное секвенирование-типирование

Сравнение нуклеотидных последовательностей таких генов позволяет относительно легко устанавливать степень филогенетического родства между популяциями и систематизировать их. Чаще исследуют 7-8 локусов, что обеспечивает достаточную разрешающую способность метода


Слайд 54
Текст слайда:

Мультилокусное секвенирование-типирование этапы исследования

1. выделения ДНК из образца исследуемых микроорганизмов
2. амплификация участков определенных локусом ПЦР с использованием подходящих праймеров
3. анализ амплифицированных участков с помощью секвенаторами
4. сравнение с помощью специальных программ полученные результаты с имеющимися в базе данных


Слайд 55
Текст слайда:

Плазмида рBR322


Слайд 56
Текст слайда:

Получение рекомбинантных плазмид


Обратная связь

Если не удалось найти и скачать презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое ThePresentation.ru?

Это сайт презентаций, докладов, проектов, шаблонов в формате PowerPoint. Мы помогаем школьникам, студентам, учителям, преподавателям хранить и обмениваться учебными материалами с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика