- Главная
- Разное
- Дизайн
- Бизнес и предпринимательство
- Аналитика
- Образование
- Развлечения
- Красота и здоровье
- Финансы
- Государство
- Путешествия
- Спорт
- Недвижимость
- Армия
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Эволюционная иммунология. Защитные системы прокариот презентация
Содержание
- 1. Эволюционная иммунология. Защитные системы прокариот
- 2. Зачем вообще изучать защитные системы микробов? «We
- 3. Фаги регулируют микробиоту кишечника
- 4. Фаги как маркер (или причина) дисбиоза
- 5. Система CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) – Cas (Cass)
- 6. Система CRISPR-Cas защищает бактерий от бактериофагов
- 7. Характеристики системы CRISPR Присуща практически всем археям
- 8. Предполагалось, что CRISPR-Cas действует по схожему с
- 9. Принципиальная структура CRISPR
- 10. Открытие CRISPR
- 11. Принцип сполиготипирования
- 12. История открытия функции CRISPR Родольф Баррангу Филипп Хорват DANISCO
- 13. Разнообразие спейсеров и приобретение новых РАМ –
- 14. Примеры некоторых proto-spacer adjacent motifs (РАМ)
- 15. Cas-белки и их функции
- 16. Классификация систем на основе CRISPR Евгений Кунин Кира Макарова
- 17. Классификация вариантов CISPR-Cas
- 18. Новая классификация CISPR-Cas (2015 г.)
- 20. Cascade
- 21. Процессинг РНК в системе CRISPR I типа
- 22. Процессинг РНК в системе CRISPR II типа
- 23. Система II типа Система I типа
- 24. Почему нет атаки на саму CRISPR-кассету?
- 25. Атака ДНК-мишени возможна и в случае неполного
- 26. Распространенность CRISPR-Cas
- 27. Эволюция систем CRISPR-Cas
- 28. Применение Cas9 для редактирования генома Feng Zhang Jennifer Doudna Emmanuelle Charpentier
- 29. Редактирование геномов эукариот при помощи CRISPR-Cas9
- 30. Химерная РНК, совмещающая элементы crРНК и tracrРНК Martin Jinek
- 31. Белок Cas9 и химерная tracr-crРНК способны эффективно редактировать любые геномы
- 32. CRISPR – история открытия (резюме)
- 34. Где уже применили Cas9? 2017 2012 2013
- 36. «Ножницы для генома» не гарантируют его адекватное сшивание после разрезания
- 37. Трансгенные мыши, получаемые с использованием Cas9 Masahito Ikawa
- 38. MCR – mutagenic chain reaction
- 39. Этическая сторона вопроса
- 40. Cpf1 – альтернатива Cas9
- 41. Анти-CRISPR системы
- 42. Механизмы работ анти-CRISPR систем
- 43. CRISPR-Cas может быть направлена и против фагов с РНК-геномом (VI тип) Leptotrichia shahii
- 44. Успешная кооперация защитных систем
- 45. Отсутствие кооперации защитных систем
- 46. Судьба древних прокариотических защитных систем и происхождение эукариот
- 47. Следующая лекция 26 февраля – об иммунитете растений, грибов и протистов
Зачем вообще изучать защитные системы микробов? «We observed a significant decrease in the ability of the cas9 mutant to adhere to, invade and replicate in human epithelial cells, leading to an
Слайд 2Зачем вообще изучать защитные системы микробов?
«We observed a significant decrease in
the ability of the cas9 mutant to adhere to, invade and replicate in human epithelial cells, leading to an overall defect in survival, indicating that Cas9 plays an important role in N. meningitidis pathogenesis. Additionally, a recent study identified Campylobacter jejuni Cas9 as critical for interactions with host cells23. Bioinformatic analysis predicted that N. meningitidis, C. Jejuni and other pathogens may encode a scaRNA, which is critical for Cas9 targeting of endogenous mRNA. Together, these results clearly show that Cas9 controls virulence traits of several bacteria.»
Слайд 6Система CRISPR-Cas защищает бактерий от бактериофагов
1. ДНК бактериофага нарезается специальными Cas-белками
бак-терии на маленькие фрагменты. Они добавляются в определен-ный участок генома бактерии, который называется CRISPR. Если бактерия не погибает, то она таким образом «запоминает» часть генома вируса.
2. Со всего, что находится в CRISPR, синтезируются специальные РНК, постоянно проверяющие, не комплементарны ли они какой-нибудь ДНК, попавшей в бактерию.
3. Если совпадение найдено, значит в бактерию попала ДНК такого же вируса, как и раньше. Его «вспоминают» и уничтожают другие Cas-белки.
Слайд 7Характеристики системы CRISPR
Присуща практически всем археям и половине бактерий
CRISPR-кассета состоит из
одинаковых повторов и различающихся спейсеров, причём повторы не являются консервативными, однако часто начинаются на 5`-GTTTC и заканчиваются на GAAAC-3`
По соседству с CRISPR-кассетой находится оперон cas-генов
Среди продуктов cas-генов выделяются 6 основных и множество вспомогательных белков (RAMP)
В одном геноме может быть до 18 CRISPR-кассет
В одной CRISPR-кассете может быть до 375 спейсеров
Повторы варьируют в размере в диапазоне 23 – 47 п.н., спейсеры – 21 – 72 п.н.
По соседству с CRISPR-кассетой находится оперон cas-генов
Среди продуктов cas-генов выделяются 6 основных и множество вспомогательных белков (RAMP)
В одном геноме может быть до 18 CRISPR-кассет
В одной CRISPR-кассете может быть до 375 спейсеров
Повторы варьируют в размере в диапазоне 23 – 47 п.н., спейсеры – 21 – 72 п.н.
Слайд 8Предполагалось, что CRISPR-Cas действует по схожему с РНК-интерференцией механизму…
… и она
действительно может быть направлена против РНК, однако основной ее мишенью является двунитевая ДНК
Слайд 10Открытие CRISPR
Yoshizumi Ishino
Ishino, Y., et al. (1987). Nucleotide
sequence of the iap gene, responsible for alkaline phosphatase isozyme conversion in Escherichia coli, and identification of the gene product. J. Bacteriol. 169, 5429–5433.
Francisco Mojica
Mojica, F.J.M et al. (1993). Transcription at
different salinities of Haloferax mediterranei sequences adjacent to partially modified PstI sites. Mol. Microbiol. 9, 613–621.
Слайд 13Разнообразие спейсеров и приобретение новых
РАМ – нуклеотидный мотив, который позволяет исполь-зовать
часть чужеродной ДНК в качестве пригодной для создания нового спейсера
Слайд 24Почему нет атаки на саму CRISPR-кассету?
Критическим является строгое Уотсон-Криковское связывание -2
– -4 нуклеотида к 5`-концу от спейсера. Если оно есть, значит «ДНК-мишень» - своя, и расщеплять её нельзя
Слайд 25Атака ДНК-мишени возможна и в случае неполного соответствия спейсера и протоспейсера.
Критическим
является связывание 5`-конца спейсера
