Слайд 2Во время жизни животных и человека наблюдается 2 типа ЗПКГ: апоптоз
и аутофагия (mTOR). Термин ввели Kerr с соавт. в 1971 г. Через 20 лет открыто новое семейство протеаз – каспазы.
Слайд 4Изменение ультраструктуры клеток при некрозе и апоптозе
Слайд 5Последовательность событий при апоптозе (справа) и некрозе (слева)
Слайд 7Стадии апоптоза
1. Индукция. Изменения в клеточном окружении, приводящие к активации апоптоза
через R и СТ
2. Исполнение. Клетка решает войти в апоптоз.
3. Дегенерация. События, связанные с конечным развертыванием клеточных процессов, позволяющих подойти клетке к точке, откуда нет возврата.
Слайд 8Индукторы и супрессоры апоптоза
Индукторы: дефицит ФР, глюкозы, УФ и гамма-излучение, перекись,
ПОЛ, ГК гормоны, ТХДД, ФНО, экспрессия проапоптотических генов сем. Bcl-2 цитолитические Т-лимфоциты, вирусы, химиотерапевтические лекарства и др.
Супрессоры: экспрессия антиапоптотических генов сем. Bcl-2, MDR, теломеразы, ингибиторы синтеза РНК и белков, мут.р53 и др.
Слайд 11Лиганды и рецепторы
Лиганды: сем. гомотримерных лигандов TNF - FasL, TRAIL (Apo2L),
TNF α и β, CD40L,CD27L, OX40L.
Рецепторы: FAS и др. рецепторы семейства TNF
Слайд 12Взаимодействие лиганда смерти TRAIL с рецептором
Слайд 13Зависимый от Fas-рецептора апоптоз при действии цитотоксического Т-лимфоцита
Слайд 14два варианта
рецептор-опосредованного апоптоза
Слайд 17Fas/FADD/pro-caspase комплекс образует Fas death-inducing signaling complex (DISC)
Слайд 18TNF-R1 инициирует образование 2-х комплексов
Комплекс I (голубой) содержит TNF-R1, адаптор TRADD,
receptor interacting kinase (RIP), и TNF-receptor
ssociated factor 2 (TRAF2).
TNF-α активирует NF-kB путь, который индуцирует гены выживания c-FLIP. Позже из комплекса I диссоциируется и интернализируется
TNF-R1.
Слайд 19Потеря экспрессии FADD дает раковой клетке преимущество выживание/рост
Слайд 26
Множество белков IMS (intermembrane space) высвобождается, когда активируются внутриклеточные сигналы индукции
апоптоза
Целостность митохондриального матрикса контролируется Bcl-2 сем.
BH-3-белки активируются при стрессе. Bid, например, расщепляется многими протеазами (caspase-8, granzyme B и cathepsin B) в tBid, который взаимодействует с антиап. Bcl-2 белками и может напрямую активировать Bax. Другие BH-3-белки ненапрямую активируют Bax, блокируя антиап. Bcl-2. Цитозольный cyt c запускает образование апоптосомы через каскад каспаз. Для них много субстратов:
ICAD, в результате активируется CAD, к. транслоцируется в ядро и начинает олигонуклеосомальную фрагментацию ДНК.
IAPs предотвращает димеризацию caspase-9 и блокирует активные caspase-3 и -7. Smac/DIABLO (Smac) и HtrA2/OMI (Omi) нейтрализуют
Ингибирующий эффект IAP связыванием с BIR2 и BIR3 доменами. Димерный Smac/DIABLO связывает BIR1 и BIR2, а HtrA2/
OMI преимущественно связывает BIR2 белка XIAP. Кроме того, Omi может расщеплять IAPs благодаря серин-протеазной активности. Smac – субстрат для деградации УБ-протеосомами, находясь в
C-terminal RING домене белка XIAP и cIAP1 и cIAP2. AIF и endonuclease G (endo G) переходят из мтх. В ядро, где расщепляют ДНК (независимо от каспаз).
Слайд 28B CELL LYMPHOMA-2 (BCL-2)
Семейство белков BCL-2
Слайд 30Способы взаимодействия между белками Bcl-2
Слайд 33Регуляция мтх. апоптоза (2)
(a) Модель реостата. Обычно в клетке равновесие. Дисбаланс
белков bcl-2 семейства, например, повреждение ДНК, ведет к синтезу про-апоптотических молекул и активации МОМР. Добавление GF может, напротив, увеличить синтез анти-апоптотических белков.
(b) Модель нейтрализации анти-апоптотических белков. BH3-
only белки BID, BIM и PUMA вызывают mitochondrial outer membrane permeabilization, нейтрализуя анти-апоптотические белки.
Слайд 34Механизмы активации
про-апоптотических белков (1)
Модель прямой активации.
MOMP активируется через олигомеризацию
BAX или BAK. Эти белки, один раз активируется BH3-only белком, образуют протеолипидные поры.
(b) Прямой активатор BH3-only белков (e.g. BIM and BID) индуцирует олигомеризацию BAX или BAK при отсутствии других белков
Слайд 35Механизмы активации
про-апоптотических белков (2)
(c) A subset of BH3-only proteins, the de-repressors/sensitizers,
cannot induce the activation of BAX or BAK alone. In this scenario, a direct activator BH3-only protein is sequestered by an anti-apoptotic BCL-
2 protein. Following stress, a de-repressor/sensitizer BH3-only protein is induced, either by transcriptional up-regulation or by post-translational modification, and this
protein then binds to an anti-apoptotic BCL-2 protein, promoting the release of a sequestered, direct activator BH3-only protein. In this example, BIM is tonically
sequestered by MCL-1, and the induction of Noxa enables the release of BIM to engage MOMP. If cells constitutively harbor a sequestered direct activator protein, they are
referred to as being ‘primed for death’ or ‘BCL-2 addicted’. Not shown in this figure is the potential influence of Noxa-induced MCL-1 degradation after binding, which might
have important implications in maintaining anti-apoptotic levels to preserve outer mitochondrial membrane integrity [53]. (d) Cells are sensitized to undergo MOMP when
de-repressor/sensitizer BH3-only proteins are constitutively inhibiting anti-apoptotic BCL-2 proteins, and any future induction of BID or BIM cannot be tolerated. This scenario is referred to as ‘sensitized for death’. In this example, BCL-xL is inhibited by BAD, and the induction of BIM engages MOMP; in the absence of BAD expression, the MOMP signal would have been inhibited by BCL-xL.
Слайд 36СЕМЕЙСТВО ЦИСТЕИНОВЫХ ПРОТЕАЗ
Каспазы
Слайд 37Сборка каспаз
Общая структура прокаспаз и протеолитическое созревание расщеплением после остатков аспарагина.
В результате генерируется большая с (р20) и малая (р10) субъединицы, в каждой из которых формируется активный центр (кружок). Два гетеродимера складываются в тетрамер.
Слайд 38Функциональные взаимодействия между каспазами
Слайд 40Caspase-2 инициаторная каспаза, наиболее эволюционно консервативная, действует upstream от митохондрий. Вовлечена
в расщепление Bid и транслокации Bax
Слайд 41Доменная организация компонентов Death Inducing Signaling Complex (DISC), Fas, FADD, и
caspase-8, 10
Слайд 42Структурная организация каспаз
Структура и доменная организация каспаз млекопитающих. (a) каталитическая петля
(L1–L4). Инициаторные каспазы содержат большие продомены CARD или DED, а экзекуторные каспазы имеют короткие продомены.
Активный цент Cys показан красным.
Процессинг разделения p20 и p10
Происходит в L2. The resulting large subunit potion of the L2 loop of one monomer and small subunit portion of the L2 loop of the neighboring monomer (L20) are involved in loop bundle formation (b and c). (b) Ribbon representation of the active caspase-3
structure showing the positions of the active center loops (L1-L4, L20) based on the crystal structure of the complex of caspase-3 with peptide inhibitor (in pink). Reproduced with permission from Shi
(2002). (c) The active site conformations of the caspases with known structures. Loops L1 and L3 are highly conserved, whereas L2 and L4 are responsible for the differences in substrate binding specificity. Reproduced with permission from Shi (2002). CARD, caspase recruitment domain; DED, death effector domain
Слайд 44CK-2 киназы –
субстраты для каспаз
Слайд 45CK-2 киназы в митозе
Схематическое изображение CK2a и CK2b с сайтами ф-я
(треонины
344 и 360, серины 362 и370 в CK2a, серин 209 в CK2b) черным. (B) Модель временной регуляции ф-я CK2a (C) Модель ф-ия CK2 в митозе. После ф-ия CK2 киназой Cdk1, CK2a C-terminal ф. сайты могут связываться с пролил изомеразой Pin1. Образование комплекса Pin1, Topoisomerase II, и ф-ый CK2a вызывает снижение ф-ия Topoisomerase II киназой CK2 . Митотическая киназа Plk1 может также связаться с C-terminal CK2a по ф. сайту. Но функция этого взаимодействия неизвестна.
Слайд 47Регуляция апоптоза ингибиторными белками
Слайд 49Взаимодействие с каспазой 3 (а) и IPVA (b)
Слайд 50Взаимодействие с каспазой 9 (а) и Smac/DIABLO (b)
Слайд 51Селективное связывание
IAP белков
Слайд 52Баланс между убиквитиляцией и автоубиквитиляцией cIAP1 and cIAP2
Слайд 53Протеолиз и апоптоз
Conjugation of Ub to target proteins is mediated by
E1, E2 and E3 enzymes. The Ub-activating enzyme E1 (ubiquitin-like modifier activating enzyme 1 [Uba-1] in mammals) activates Ub through ATP-dependent thiolester formation. The Ub-conjugating enzyme (E2) receives Ub from the E1 and interacts with the E3 to transfer
Ub to the target molecule. The E2 usually determines the type of Ub chain linkage, whereas E3 ligases provide substrate recognition. Ub chains are synthesized by
multiple rounds of Ub attachments, using internal lysine residues of Ub (shown here: K48 and K63) as conjugation sites. The different types of chains adopt different topologies with K48 being kinked, whereas K63-linked chains are linear. Depending on the type of modification, protein ubiquitylation has distinct cellular outcomes. Ub E3 ligases can also be subject to auto-modification to regulate their levels.
Слайд 55IAPs функция как E3 лигаз и
Ub рецепторы в TNF-signalling
Domain structures
of cIAPs. BIR domains provide substrate interaction, whereas the Ubbinding UBA domain binds polyUb. The caspase recruitment domain (CARD) is a protein–protein interaction domain, but is not involved in caspase binding here. The Cterminal RING domain is required for E3 ligase activity, dimerization interface and docking site for the E2. A predicted structure of the three conserved a-helices of the UBA domain (green) of cIAP2 and the residues forming the hydrophobic interaction surface for Ub (consisting of Met-Gly-Phe [MGF] and Leu-Leu [LL]) is shown [66]. The structure of a cIAP2–RING dimer is shown on the right (grey and green depict two respective cIAP2 molecules)
Слайд 56Suggested functions for cIAPs in TNF-R signalling. Stimulation with TNFa triggers
the formation of ‘complex-I’ at the TNF-R, in which cIAP has been suggested to K63-ubiquitylate RIP1. These linear Ub chains serve as docking and activation platforms for the IKK complex, which leads to activation of the transcription factor NF-kB (p65/p50). cIAPs also seem to suppress the death-inducing ‘complex-II’, which is the activation platform for caspase-8 that induces death by the extrinsic pathway.
Слайд 61Методы определения фрагментации ДНК
Слайд 63Электрофореграмма ДНК при апоптозе
Слайд 64Олигонуклеосомная фрагментация ДНК при апоптозе
Слайд 66Молекулярный имидж клеточной гибели (c 2009 г.)
Слайд 67Гистологическое окрашивание срезов печени мыши (контрольных и обработанных anti-Fas)
H&E staining of
normal (A) and anti-Fas treated livers (B). TUNEL of normal (C) and anti-Fas treated livers (D) with clearly more positively stained cells. Caspase-3 shows a clear increase of positively stained cells in an anti-Fas treated liver (F) compared to a normal liver (E). Autoradiography images are shown for liver slices of mice injected with 99mTc-HYNIC-cys-anxV before (G) and after treatment of the animals with anti-Fas (H).
Слайд 68In vivo planar image
In vivo planar image of a control
rat and a rat with reperfused hepatic infarction at 7 h post injection of 99mTc(CO)3-bis-DTPA pamoate (A). Autoradiographs of 30-μm liver slices of the necrotic liver (B, top row) and viable liver (B, bottom row) and scanned photographs of the same slices after H&E staining (C) staining show good correlation with the in vivo planar image.
Слайд 69Апоптоз в опухоли после химиотерапии
(А,В – не леченные, H&E и
TUNEL окрашивание)
Слайд 72Проточная цитометрия
в определении апоптоза
Слайд 76Макрофаги в определении апоптоза
Слайд 77Взаимодействие макрофагов с апоптотическими клетками
Слайд 78Терапевтические мишени для ингибирования апоптоза (доклиническая стадия)
Слайд 86ЗПКГ выполняет критическую роль в развитии нервной системы у позвоночных. Около
50% всех нейронов гибнет через апоптоз